26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2874 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2874  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 85 aa  169  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2535  prevent-host-death protein  72.62 
 
 		 85 aa  124  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.784194  normal  0.833179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3961  prevent-host-death family protein  61.9 
 
 		 86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.986483  normal  0.184191 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1822  prevent-host-death family protein  51.61 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.307814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0623  prevent-host-death protein  37.04 
 
 		 94 aa  52.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0012  prevent-host-death protein  45.76 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  50 
 
 		 85 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2538  prevent-host-death family protein  41.98 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.91328 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  44.44 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3421  prevent-host-death family protein  47.46 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.985918 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2918  prevent-host-death family protein  43.28 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6276  prevent-host-death family protein  40.98 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0714  prevent-host-death family protein  45.45 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667491  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12881  hypothetical protein  34.07 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  42.86 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4711  prevent-host-death family protein  38.98 
 
 		 86 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4514  prevent-host-death protein  37.5 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.680635  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2085  prevent-host-death family protein  40.32 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1697  prevent-host-death family protein  37.04 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000276102  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5092  prevent-host-death family protein  37.93 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2340  prevent-host-death family protein  36.17 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1595  prevent-host-death family protein  37.04 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0090  prevent-host-death protein  34.62 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0872  hypothetical protein  36.54 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.653193  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4285  hypothetical protein  37.14 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192464  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4580  prevent-host-death family protein  40 
 
 		 88 aa  40.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>