50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4542 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 85 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  92.94 
 
 		 85 aa  160  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2085  prevent-host-death family protein  55.81 
 
 		 86 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4105  hypothetical protein  43.21 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4580  prevent-host-death family protein  45.45 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1822  prevent-host-death family protein  39.76 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.307814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2918  prevent-host-death family protein  46.84 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5092  prevent-host-death family protein  44 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4285  hypothetical protein  42.86 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192464  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2538  prevent-host-death family protein  47.14 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.91328 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0714  prevent-host-death family protein  43.21 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667491  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4537  prevent-host-death family protein  52.17 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0623765 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5263  prevent-host-death family protein  37.65 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  38.82 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0623  prevent-host-death protein  42.47 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2874  prevent-host-death family protein  50 
 
 		 85 aa  52.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4514  prevent-host-death protein  39.02 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.680635  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2535  prevent-host-death protein  45.12 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.784194  normal  0.833179 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1212  prevent-host-death family protein  41.57 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.985049  normal  0.376618 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0546  prevent-host-death family protein  48.89 
 
 		 68 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241821  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1595  prevent-host-death family protein  34.12 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6276  prevent-host-death family protein  42.31 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2340  prevent-host-death family protein  35.71 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1697  prevent-host-death family protein  40 
 
 		 82 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000276102  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1496  prevent-host-death family protein  47.83 
 
 		 87 aa  48.9  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0844897  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1544  prevent-host-death family protein  47.83 
 
 		 87 aa  48.9  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0090  prevent-host-death protein  38.1 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3797  hypothetical protein  46.67 
 
 		 62 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.731882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5883  prevent-host-death family protein  32.91 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.635627 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3569  prevent-host-death family protein  43.1 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3421  prevent-host-death family protein  36.51 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.985918 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4711  prevent-host-death family protein  38.96 
 
 		 86 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0140  prevent-host-death family protein  34.48 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2734  prevent-host-death protein  46.34 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.431133  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0012  prevent-host-death protein  44.68 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0164  prevent-host-death family protein  41.86 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0872  hypothetical protein  37.21 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.653193  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3378  prevent-host-death family protein  35.63 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185106  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2802  prevent-host-death protein  37.74 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2136  prevent-host-death family protein  47.62 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.732701 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3345  prevent-host-death protein  33.33 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.408445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3961  prevent-host-death family protein  40.43 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.986483  normal  0.184191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0575  prevent-host-death protein  36.14 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103149  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1401  prevent-host-death family protein  42.53 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.489676 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08246  prevent-host-death family protein  30.91 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0087  hypothetical protein  34.69 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.701253  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4669  prevent-host-death family protein  36.17 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3527  prevent-host-death family protein  39.29 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378115  normal  0.865399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0333  prevent-host-death family protein  32.65 
 
 		 80 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3693  prevent-host-death family protein  32.65 
 
 		 80 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>