32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4580 on replicon NC_008244
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008244  Meso_4580  prevent-host-death family protein  100 
 
 
88 aa  177  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5263  prevent-host-death family protein  77.27 
 
 
88 aa  141  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416232  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4537  prevent-host-death family protein  79.55 
 
 
88 aa  140  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0623765 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4285  hypothetical protein  80.77 
 
 
92 aa  130  6.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192464  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  70.45 
 
 
93 aa  127  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4514  prevent-host-death protein  64.1 
 
 
91 aa  108  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.680635  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5092  prevent-host-death family protein  67.09 
 
 
112 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0714  prevent-host-death family protein  43.75 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667491  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2340  prevent-host-death family protein  37.97 
 
 
82 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  45.45 
 
 
85 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  45.45 
 
 
85 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0623  prevent-host-death protein  37.08 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1595  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1822  prevent-host-death family protein  37.97 
 
 
81 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.307814  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1697  prevent-host-death family protein  41.33 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000276102  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0012  prevent-host-death protein  37.04 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4711  prevent-host-death family protein  39.76 
 
 
86 aa  51.6  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4105  hypothetical protein  36.14 
 
 
80 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0872  hypothetical protein  38.75 
 
 
83 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.653193  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5883  prevent-host-death family protein  45 
 
 
79 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.635627 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0164  prevent-host-death family protein  38.1 
 
 
87 aa  46.2  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1496  prevent-host-death family protein  35.19 
 
 
87 aa  45.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0844897  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1544  prevent-host-death family protein  35.19 
 
 
87 aa  45.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2918  prevent-host-death family protein  34.94 
 
 
83 aa  44.7  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0094  prevent-host-death family protein  31.71 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1162  prevent-host-death family protein  40.48 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203241  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3378  prevent-host-death family protein  43.33 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185106  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0087  hypothetical protein  47.22 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.701253  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0090  prevent-host-death protein  41.67 
 
 
80 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0096  prevent-host-death family protein  33.85 
 
 
80 aa  40.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2874  prevent-host-death family protein  40 
 
 
85 aa  40.4  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4669  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 
86 aa  40  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>