49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0714 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0714  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 93 aa  189  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667491  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0012  prevent-host-death protein  49.37 
 
 		 102 aa  87.8  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2340  prevent-host-death family protein  48.1 
 
 		 82 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1595  prevent-host-death family protein  50.67 
 
 		 77 aa  80.9  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  48.91 
 
 		 93 aa  80.1  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1697  prevent-host-death family protein  46.84 
 
 		 82 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000276102  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4285  hypothetical protein  41.94 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192464  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5263  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5092  prevent-host-death family protein  44.19 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4580  prevent-host-death family protein  43.75 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0872  hypothetical protein  45 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.653193  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0623  prevent-host-death protein  43.9 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4514  prevent-host-death protein  41.67 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.680635  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4537  prevent-host-death family protein  43.04 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0623765 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1822  prevent-host-death family protein  40.51 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.307814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4711  prevent-host-death family protein  48.44 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2538  prevent-host-death family protein  45.45 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.91328 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6276  prevent-host-death family protein  42.42 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  43.21 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  51.02 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3421  prevent-host-death family protein  35.9 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.985918 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2085  prevent-host-death family protein  52.17 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0094  prevent-host-death family protein  42.86 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0096  prevent-host-death family protein  42.86 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0090  prevent-host-death protein  41.79 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2535  prevent-host-death protein  47.73 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.784194  normal  0.833179 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5883  prevent-host-death family protein  47.92 
 
 		 79 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.635627 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6403  prevent-host-death family protein  39.68 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4105  hypothetical protein  45.45 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0140  prevent-host-death family protein  47.92 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0856  prevent-host-death protein  38.1 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.162182 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2874  prevent-host-death family protein  45.45 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3930  Axe family addiction module antitoxin  37.31 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1212  prevent-host-death family protein  47.73 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.985049  normal  0.376618 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3345  prevent-host-death protein  40.3 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.408445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3828  addiction module antitoxin  37.31 
 
 		 73 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.899294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4183  prevent-host-death family protein  38.1 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4834  prevent-host-death protein  38.1 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3332  prevent-host-death family protein  38.1 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4748  prevent-host-death family protein  38.1 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2918  prevent-host-death family protein  31.71 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3078  prevent-host-death protein  38.81 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.018345  normal  0.547068 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3961  prevent-host-death family protein  36.96 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.986483  normal  0.184191 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3378  prevent-host-death family protein  45.83 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185106  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3164  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.332735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1710  prevent-host-death protein  39.02 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2838  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  36.51 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0680  prevent-host-death protein  33.33 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.219164  normal  0.89049 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2530  prevent-host-death protein  41.51 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>