28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0140 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0140  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 83 aa  164  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3378  prevent-host-death family protein  93.98 
 
 		 83 aa  154  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185106  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0090  prevent-host-death protein  61.45 
 
 		 80 aa  101  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5883  prevent-host-death family protein  62.65 
 
 		 79 aa  101  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.635627 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3345  prevent-host-death protein  60.53 
 
 		 92 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.408445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3078  prevent-host-death protein  57.89 
 
 		 80 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.018345  normal  0.547068 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2530  prevent-host-death protein  67.21 
 
 		 69 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0575  prevent-host-death protein  48.1 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103149  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2085  prevent-host-death family protein  44.12 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1710  prevent-host-death protein  44.44 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4105  hypothetical protein  42.86 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  47.22 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0714  prevent-host-death family protein  47.92 
 
 		 93 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667491  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1697  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000276102  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3930  Axe family addiction module antitoxin  34.25 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3527  prevent-host-death family protein  39.51 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378115  normal  0.865399 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  34.48 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1595  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  33.8 
 
 		 85 aa  43.9  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3828  addiction module antitoxin  35.94 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.899294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1212  prevent-host-death family protein  36.23 
 
 		 101 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.985049  normal  0.376618 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2918  prevent-host-death family protein  32.39 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3797  hypothetical protein  41.67 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.731882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0623  prevent-host-death protein  39.34 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2340  prevent-host-death family protein  38.78 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0546  prevent-host-death family protein  39.68 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241821  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4514  prevent-host-death protein  45.71 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.680635  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4285  hypothetical protein  42.59 
 
 		 92 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>