34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4514 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4514  prevent-host-death protein  100 
 
 		 91 aa  183  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.680635  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4285  hypothetical protein  62.65 
 
 		 92 aa  114  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192464  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  66.25 
 
 		 93 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4580  prevent-host-death family protein  64.1 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5263  prevent-host-death family protein  57.65 
 
 		 88 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4537  prevent-host-death family protein  60.26 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0623765 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5092  prevent-host-death family protein  63.51 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0714  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 		 93 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667491  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1822  prevent-host-death family protein  38.27 
 
 		 81 aa  57  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.307814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2340  prevent-host-death family protein  34.18 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0012  prevent-host-death protein  38.04 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  39.02 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  39.02 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0872  hypothetical protein  37.5 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.653193  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0623  prevent-host-death protein  36.36 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4711  prevent-host-death family protein  38.27 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5883  prevent-host-death family protein  44.26 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.635627 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2918  prevent-host-death family protein  30.38 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6276  prevent-host-death family protein  42.37 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2085  prevent-host-death family protein  37.93 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2874  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2538  prevent-host-death family protein  42.37 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.91328 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0164  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2535  prevent-host-death protein  40 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.784194  normal  0.833179 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1595  prevent-host-death family protein  33.78 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1544  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1496  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0844897  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3378  prevent-host-death family protein  47.37 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185106  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3961  prevent-host-death family protein  40 
 
 		 86 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.986483  normal  0.184191 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1300  prevent-host-death family protein  32.14 
 
 		 89 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0096  prevent-host-death family protein  36 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1212  prevent-host-death family protein  30.21 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.985049  normal  0.376618 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0094  prevent-host-death family protein  36 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0140  prevent-host-death family protein  45.71 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>