29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5263 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5263  prevent-host-death family protein  100 
 
 
88 aa  176  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416232  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4537  prevent-host-death family protein  85.23 
 
 
88 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0623765 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4580  prevent-host-death family protein  77.27 
 
 
88 aa  141  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4285  hypothetical protein  75.9 
 
 
92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192464  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  72.15 
 
 
93 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5092  prevent-host-death family protein  75.34 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4514  prevent-host-death protein  57.65 
 
 
91 aa  104  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.680635  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0714  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 
93 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667491  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2340  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 
82 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  38.82 
 
 
85 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  37.65 
 
 
85 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0872  hypothetical protein  37.8 
 
 
83 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.653193  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0012  prevent-host-death protein  37.5 
 
 
102 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0623  prevent-host-death protein  38.04 
 
 
94 aa  54.7  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1595  prevent-host-death family protein  39.47 
 
 
77 aa  54.3  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4711  prevent-host-death family protein  40.54 
 
 
86 aa  53.9  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1697  prevent-host-death family protein  40.26 
 
 
82 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000276102  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1822  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 
81 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.307814  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4105  hypothetical protein  36.14 
 
 
80 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5883  prevent-host-death family protein  45 
 
 
79 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.635627 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0164  prevent-host-death family protein  35.71 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1212  prevent-host-death family protein  32.58 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.985049  normal  0.376618 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0094  prevent-host-death family protein  29.27 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2918  prevent-host-death family protein  32.93 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1162  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203241  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3797  hypothetical protein  37.5 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.731882  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0087  hypothetical protein  42.86 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.701253  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0546  prevent-host-death family protein  43.48 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241821  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0096  prevent-host-death family protein  31.82 
 
 
80 aa  40.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>