35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0546 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0546  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 68 aa  137  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241821  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3797  hypothetical protein  76.6 
 
 		 62 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.731882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3569  prevent-host-death family protein  71.74 
 
 		 74 aa  75.5  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2136  prevent-host-death family protein  74.47 
 
 		 62 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.732701 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2802  prevent-host-death protein  47.22 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0784  prevent-host-death protein  61.76 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.735583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0437  prevent-host-death family protein  73.91 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.074923  normal  0.870899 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08246  prevent-host-death family protein  56.52 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  48.89 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  48.89 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0087  hypothetical protein  39.71 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.701253  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5521  prevent-host-death family protein  37.31 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133668  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0429  prevent-host-death family protein  47.83 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3693  prevent-host-death family protein  45.65 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1066  prevent-host-death family protein  51.06 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0333  prevent-host-death family protein  45.65 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4669  prevent-host-death family protein  45.83 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1991  prevent-host-death family protein  45.65 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0190  prevent-host-death family protein  45.65 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4559  prevent-host-death family protein  45.65 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3472  prevent-host-death family protein  45.65 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0936  hypothetical protein  45.65 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00200085  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5128  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 86 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5318  prevent-host-death protein  42.11 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4379  prevent-host-death family protein  32.14 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.355289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6194  prevent-host-death family protein  33.93 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00572881  normal  0.0262754 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6509  prevent-host-death family protein  32.14 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.104787  normal  0.482695 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02236  Antitoxin of toxin-antitoxin system Phd  45.65 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.934287  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5263  prevent-host-death family protein  43.48 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4748  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3378  prevent-host-death family protein  40.32 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185106  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0140  prevent-host-death family protein  39.68 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4513  prevent-host-death protein  41.67 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.475563  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5883  prevent-host-death family protein  39.58 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.635627 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1300  prevent-host-death family protein  34.78 
 
 		 89 aa  40  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>