27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3569 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3569  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 74 aa  147  7e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0546  prevent-host-death family protein  71.74 
 
 		 68 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241821  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3797  hypothetical protein  73.91 
 
 		 62 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.731882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2136  prevent-host-death family protein  52.05 
 
 		 62 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.732701 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0784  prevent-host-death protein  72.34 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.735583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2802  prevent-host-death protein  42.55 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0437  prevent-host-death family protein  68.18 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.074923  normal  0.870899 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08246  prevent-host-death family protein  46.81 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1066  prevent-host-death family protein  47.83 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  46.67 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  43.1 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3693  prevent-host-death family protein  40.43 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0333  prevent-host-death family protein  40.43 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0936  hypothetical protein  38.3 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00200085  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0087  hypothetical protein  38.3 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.701253  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0429  prevent-host-death family protein  38.3 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5521  prevent-host-death family protein  31.25 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133668  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4669  prevent-host-death family protein  37.21 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5883  prevent-host-death family protein  40.43 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.635627 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1991  prevent-host-death family protein  36.17 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4559  prevent-host-death family protein  36.17 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0190  prevent-host-death family protein  36.17 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3472  prevent-host-death family protein  36.17 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4593  prevent-host-death protein  36.36 
 
 		 189 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.918912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5318  prevent-host-death protein  33.9 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6498  prevent-host-death family protein  51.43 
 
 		 92 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.756783 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5802  prevent-host-death family protein  51.43 
 
 		 92 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226627  hitchhiker  0.00969528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>