24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3693 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0333  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 80 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3693  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 80 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0429  prevent-host-death family protein  98.75 
 
 		 80 aa  163  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0936  hypothetical protein  73.75 
 
 		 80 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00200085  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08246  prevent-host-death family protein  52.5 
 
 		 86 aa  90.9  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4669  prevent-host-death family protein  47.5 
 
 		 86 aa  77  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0087  hypothetical protein  46.25 
 
 		 86 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.701253  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3472  prevent-host-death family protein  45 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4559  prevent-host-death family protein  45 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0190  prevent-host-death family protein  45 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1991  prevent-host-death family protein  45 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2802  prevent-host-death protein  40.54 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0546  prevent-host-death family protein  45.65 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241821  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02236  Antitoxin of toxin-antitoxin system Phd  41.3 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.934287  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3569  prevent-host-death family protein  40.43 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3797  hypothetical protein  34.78 
 
 		 62 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.731882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1300  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5550  prevent-host-death family protein  30.88 
 
 		 84 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0473794 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1066  prevent-host-death family protein  32.76 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4379  prevent-host-death family protein  30.59 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.355289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5521  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133668  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  32.65 
 
 		 85 aa  40  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  32.65 
 
 		 85 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2649  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 		 84 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>