26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5521 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5521  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 87 aa  181  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133668  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2802  prevent-host-death protein  37.5 
 
 		 81 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0546  prevent-host-death family protein  37.31 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241821  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5318  prevent-host-death protein  44.64 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3797  hypothetical protein  39.13 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.731882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5707  prevent-host-death family protein  32.86 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08246  prevent-host-death family protein  42.55 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0087  hypothetical protein  32.53 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.701253  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0936  hypothetical protein  41.18 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00200085  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02236  Antitoxin of toxin-antitoxin system Phd  42.86 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.934287  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2136  prevent-host-death family protein  40.48 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.732701 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0238  prevent-host-death family protein  31.03 
 
 		 91 aa  42.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.030686  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4669  prevent-host-death family protein  34.33 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2645  prevent-host-death family protein  32.86 
 
 		 91 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3569  prevent-host-death family protein  31.25 
 
 		 74 aa  41.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1300  prevent-host-death family protein  39.13 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5328  prevent-host-death family protein  43.18 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0429  prevent-host-death family protein  35.29 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1598  prevent-host-death family protein  39.58 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5354  prevent-host-death family protein  25.71 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.250288 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2906  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 87 aa  40.4  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2678  prevent-host-death protein  36 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00646262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4513  prevent-host-death protein  45.95 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.475563  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1800  prevent-host-death protein  37.5 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0333  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3693  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>