34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2678 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2678  prevent-host-death protein  100 
 
 		 99 aa  191  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00646262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0848  prevent-host-death family protein  47.19 
 
 		 99 aa  82.8  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3587  prevent-host-death family protein  45.56 
 
 		 96 aa  80.1  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11273  hypothetical protein  45.12 
 
 		 89 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00877977  hitchhiker  0.00820754 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0238  prevent-host-death family protein  45.12 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.030686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7794  hypothetical protein  45.95 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27240  prevent-host-death family protein  45.95 
 
 		 82 aa  65.5  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00695261  normal  0.193392 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2645  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1166  prevent-host-death family protein  39.53 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2681  prevent-host-death family protein  41.11 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0623727  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0407  prevent-host-death family protein  36.36 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.951779  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12881  hypothetical protein  32.43 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1941  prevent-host-death family protein  37.33 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2293  prevent-host-death family protein  35.14 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0178348 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1927  prevent-host-death family protein  35.14 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00504779  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1841  prevent-host-death protein  35.14 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208689  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0225  prevent-host-death family protein  29.49 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01350  prevent-host-death family protein  35.14 
 
 		 85 aa  44.7  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3298  hypothetical protein  35.14 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1845  hypothetical protein  37.84 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0247  prevent-host-death family protein  33.78 
 
 		 83 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1423  prevent-host-death family protein  27.59 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00770487  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1443  prevent-host-death family protein  41.27 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0794  prevent-host-death family protein  33.78 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1443  prevent-host-death protein  41.3 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.907457  normal  0.0368823 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1939  prevent-host-death family protein  31.08 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2940  hypothetical protein  31.25 
 
 		 94 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2120  prevent-host-death family protein  31.75 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000225731  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1402  prevent-host-death family protein  37.84 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333938  normal  0.826973 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0351  prevent-host-death family protein  31.08 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2939  prevent-host-death family protein  56.41 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.100426  normal  0.275009 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0337  prevent-host-death family protein  32.5 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.703493  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5521  prevent-host-death family protein  36 
 
 		 87 aa  40.4  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133668  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13393  hypothetical protein  43.48 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.046844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>