39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2645 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2645  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 91 aa  181  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0238  prevent-host-death family protein  68.13 
 
 		 91 aa  127  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.030686  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12881  hypothetical protein  48.35 
 
 		 93 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0848  prevent-host-death family protein  46.59 
 
 		 99 aa  81.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11273  hypothetical protein  45.35 
 
 		 89 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00877977  hitchhiker  0.00820754 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3587  prevent-host-death family protein  42.68 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2678  prevent-host-death protein  41.67 
 
 		 99 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00646262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7794  hypothetical protein  38.82 
 
 		 94 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2681  prevent-host-death family protein  38.55 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0623727  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1941  prevent-host-death family protein  40.79 
 
 		 95 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27240  prevent-host-death family protein  42.31 
 
 		 82 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00695261  normal  0.193392 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1166  prevent-host-death family protein  35.37 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0869  addiction module antitoxin, Axe family  38.57 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0994  prevent-host-death family protein  38.57 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000587691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2039  prevent-host-death family protein  36.14 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274153 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13393  hypothetical protein  36.36 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.046844 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2964  prevent-host-death family protein  36.25 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2606  prevent-host-death family protein  42.19 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0044  prevent-host-death family protein  38.57 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10272  hypothetical protein  35.29 
 
 		 169 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.102894 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5998  prevent-host-death protein:addiction module toxin, Txe/YoeB  40.38 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0407  prevent-host-death family protein  38.18 
 
 		 87 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.951779  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2120  prevent-host-death family protein  32.88 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000225731  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1710  prevent-host-death protein  38.57 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3298  hypothetical protein  37.5 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0452  prevent-host-death protein  52.5 
 
 		 91 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5521  prevent-host-death family protein  32.86 
 
 		 87 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133668  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0975  prevent-host-death protein  32.5 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0832169  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0862  hypothetical protein  29.63 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1787  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2309  antitoxin YefM  41.82 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.516264  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1639  prevent-host-death family protein  41.82 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0329629  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2448  prevent-host-death family protein  32 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1214  antitoxin YefM  41.82 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2156  antitoxin YefM  41.82 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1319  prevent-host-death family protein  32.1 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000582533  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0989  prevent-host-death family protein  33.93 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0351  prevent-host-death family protein  28.05 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2469  prevent-host-death family protein  45.65 
 
 		 96 aa  40  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>