59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2039 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2039  prevent-host-death family protein  100 
 
 
95 aa  186  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.274153 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2531  prevent-host-death family protein  59.34 
 
 
92 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2087  prevent-host-death protein  45.26 
 
 
95 aa  94  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000757578  unclonable  0.0000000885843 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2432  prevent-host-death family protein  53.93 
 
 
95 aa  89.4  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1402  prevent-host-death family protein  50 
 
 
84 aa  63.9  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333938  normal  0.826973 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3885  prevent-host-death family protein  54.95 
 
 
93 aa  63.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01350  prevent-host-death family protein  41.56 
 
 
85 aa  61.6  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3814  putative YefM protein  43.04 
 
 
84 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000265887 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0311  prevent-host-death family protein  37.84 
 
 
84 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1208  prevent-host-death protein  40.58 
 
 
84 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0975  prevent-host-death protein  43.48 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0832169  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5458  prevent-host-death family protein  45.31 
 
 
74 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4160  prevent-host-death family protein  47.69 
 
 
72 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.505447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4120  prevent-host-death family protein  47.69 
 
 
72 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01044  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system, StbD family protein  52.08 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4434  prevent-host-death family protein  30.38 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.318074  normal  0.388841 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0554  antitoxin  43.33 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0694482  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3298  hypothetical protein  39.24 
 
 
87 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0390  prevent-host-death family protein  43.94 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2940  hypothetical protein  33.33 
 
 
94 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1845  hypothetical protein  35.44 
 
 
83 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745967  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0247  prevent-host-death family protein  35.62 
 
 
83 aa  50.8  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1639  prevent-host-death family protein  35.06 
 
 
83 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0329629  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0028  prevent-host-death protein  36.23 
 
 
86 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0227799  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3489  prevent-host-death protein  36.11 
 
 
86 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00502392  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1214  antitoxin YefM  35.06 
 
 
83 aa  50.1  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4877  prevent-host-death family protein  36.11 
 
 
86 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2156  antitoxin YefM  35.06 
 
 
83 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2309  antitoxin YefM  35.06 
 
 
83 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.516264  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5409  prevent-host-death family protein  36.11 
 
 
86 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0844  prevent-host-death protein  36.11 
 
 
86 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0811736 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1939  prevent-host-death family protein  35.06 
 
 
83 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5287  prevent-host-death family protein  39.47 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0662178  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5485  prevent-host-death protein  41.33 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.822453 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5885  prevent-host-death family protein  41.33 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4765  prevent-host-death family protein  34.72 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4634  prevent-host-death protein  40.3 
 
 
107 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374921  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13393  hypothetical protein  36.9 
 
 
91 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.046844 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2448  prevent-host-death family protein  34.33 
 
 
84 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1841  prevent-host-death protein  36.67 
 
 
97 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208689  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1308  prevent-host-death protein  33.82 
 
 
112 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0794  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 
83 aa  46.2  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2645  prevent-host-death family protein  36.14 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1752  prevent-host-death family protein  37.78 
 
 
121 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0588193 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3894  prevent-host-death family protein  29.87 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1927  prevent-host-death family protein  29.11 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00504779  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4023  prevent-host-death family protein  34.72 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0238  prevent-host-death family protein  36.05 
 
 
91 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.030686  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2293  prevent-host-death family protein  32.81 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0178348 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14180  prevent-host-death family protein  38.24 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.662389  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16280  Prevent-host-death protein  32.84 
 
 
69 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0407  prevent-host-death family protein  37.68 
 
 
87 aa  43.9  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.951779  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4120  hypothetical protein  30.14 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0337  prevent-host-death family protein  35 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.703493  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3147  prevent-host-death family protein  32.39 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2972  prevent-host-death family protein  32.39 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.297792 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6160  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  36.92 
 
 
91 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1663  prevent-host-death family protein  40.91 
 
 
92 aa  41.6  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3905  prevent-host-death family protein  38.18 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.542624  normal  0.0844002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>