36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2681 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2681  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 94 aa  177  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0623727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7794  hypothetical protein  53.26 
 
 		 94 aa  94.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1941  prevent-host-death family protein  44.74 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3587  prevent-host-death family protein  40.66 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11273  hypothetical protein  42.17 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00877977  hitchhiker  0.00820754 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2645  prevent-host-death family protein  38.55 
 
 		 91 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2678  prevent-host-death protein  41.11 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00646262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0848  prevent-host-death family protein  40.22 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0238  prevent-host-death family protein  38.55 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.030686  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1166  prevent-host-death family protein  37.8 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0044  prevent-host-death family protein  40.85 
 
 		 80 aa  50.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0351  prevent-host-death family protein  31.71 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1939  prevent-host-death family protein  36.49 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12881  hypothetical protein  28.92 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0247  prevent-host-death family protein  34.67 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0869  addiction module antitoxin, Axe family  38.03 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0994  prevent-host-death family protein  38.03 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000587691 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27240  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00695261  normal  0.193392 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2964  prevent-host-death family protein  36.62 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2940  hypothetical protein  30.77 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2622  prevent-host-death family protein  29.07 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1319  prevent-host-death family protein  25.58 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000582533  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3905  prevent-host-death family protein  40 
 
 		 83 aa  44.3  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.542624  normal  0.0844002 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4023  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13393  hypothetical protein  37.65 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.046844 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1845  hypothetical protein  34.67 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0794  prevent-host-death family protein  35.14 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0407  prevent-host-death family protein  35 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.951779  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0337  prevent-host-death family protein  35.53 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.703493  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1927  prevent-host-death family protein  29.33 
 
 		 83 aa  41.2  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00504779  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1101  prevent-host-death protein  36.49 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2293  prevent-host-death family protein  29.33 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0178348 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0311  prevent-host-death family protein  28.75 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4120  hypothetical protein  30.67 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3629  prevent-host-death family protein  29.27 
 
 		 86 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2479  prevent-host-death family protein  29.27 
 
 		 86 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>