49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2964 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2964  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 80 aa  162  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0044  prevent-host-death family protein  83.75 
 
 		 80 aa  140  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0994  prevent-host-death family protein  80 
 
 		 80 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000587691 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0869  addiction module antitoxin, Axe family  80 
 
 		 80 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1787  prevent-host-death family protein  70 
 
 		 80 aa  120  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2606  prevent-host-death family protein  63.75 
 
 		 80 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1443  prevent-host-death family protein  60 
 
 		 80 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0075  prevent-host-death family protein  58.75 
 
 		 80 aa  101  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2263  prevent-host-death family protein  47.95 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15090  Phd_YefM  46.05 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.239627  normal  0.743101 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2555  prevent-host-death protein  50 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.29386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13393  hypothetical protein  42.42 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.046844 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0978  prevent-host-death family protein  42.65 
 
 		 59 aa  57  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.6301 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3629  prevent-host-death family protein  35.44 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2479  prevent-host-death family protein  35.44 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5485  prevent-host-death protein  36.84 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.822453 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5885  prevent-host-death family protein  36.84 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3271  prevent-host-death family protein  40 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.567197  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2484  prevent-host-death family protein  34.33 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000069999  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2533  prevent-host-death family protein  34.33 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000898748  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12881  hypothetical protein  40 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3587  prevent-host-death family protein  41.38 
 
 		 96 aa  50.8  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1939  prevent-host-death family protein  41.38 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0247  prevent-host-death family protein  35.71 
 
 		 83 aa  50.4  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0407  prevent-host-death family protein  36.25 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.951779  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0238  prevent-host-death family protein  38.46 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.030686  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1663  prevent-host-death family protein  39.29 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11273  hypothetical protein  37.14 
 
 		 89 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00877977  hitchhiker  0.00820754 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0351  prevent-host-death family protein  35.71 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0311  prevent-host-death family protein  38.98 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0848  prevent-host-death family protein  35.9 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2645  prevent-host-death family protein  36.25 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0337  prevent-host-death family protein  32.89 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.703493  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1751  prevent-host-death protein  32.35 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4023  prevent-host-death family protein  35.71 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2681  prevent-host-death family protein  36.62 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0623727  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1845  hypothetical protein  35.71 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2089  RelB  33.77 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.674522  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1841  prevent-host-death protein  43.86 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208689  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2972  prevent-host-death family protein  38.03 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.297792 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2293  prevent-host-death family protein  32.86 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0178348 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3147  prevent-host-death family protein  38.03 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1927  prevent-host-death family protein  32.86 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00504779  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0794  prevent-host-death family protein  34.29 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3905  prevent-host-death family protein  37.93 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.542624  normal  0.0844002 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1941  prevent-host-death family protein  31.17 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2940  hypothetical protein  38.18 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1545  hypothetical protein  41.86 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0028  prevent-host-death protein  30.51 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0227799  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>