70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2555 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2555  prevent-host-death protein  100 
 
 		 85 aa  173  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.29386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5885  prevent-host-death family protein  66.2 
 
 		 94 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5485  prevent-host-death protein  66.2 
 
 		 94 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.822453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13393  hypothetical protein  63.38 
 
 		 91 aa  94  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.046844 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1663  prevent-host-death family protein  53.57 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0311  prevent-host-death family protein  45.57 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1639  prevent-host-death family protein  46.05 
 
 		 83 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0329629  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2156  antitoxin YefM  46.05 
 
 		 83 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2309  antitoxin YefM  46.05 
 
 		 83 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.516264  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1214  antitoxin YefM  46.05 
 
 		 83 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0794  prevent-host-death family protein  45.45 
 
 		 83 aa  70.5  0.000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3894  prevent-host-death family protein  44.87 
 
 		 88 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4023  prevent-host-death family protein  46.25 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1845  hypothetical protein  44.3 
 
 		 83 aa  67  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0247  prevent-host-death family protein  44.87 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2263  prevent-host-death family protein  40 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2293  prevent-host-death family protein  42.86 
 
 		 83 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0178348 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1927  prevent-host-death family protein  42.86 
 
 		 83 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00504779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1443  prevent-host-death family protein  43.48 
 
 		 80 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1939  prevent-host-death family protein  41.03 
 
 		 83 aa  63.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0075  prevent-host-death family protein  40.96 
 
 		 80 aa  63.5  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1308  prevent-host-death protein  44.44 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1752  prevent-host-death family protein  43.75 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0588193 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0994  prevent-host-death family protein  48.28 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000587691 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0869  addiction module antitoxin, Axe family  48.28 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2606  prevent-host-death family protein  49.09 
 
 		 80 aa  60.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1787  prevent-host-death family protein  42.65 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2964  prevent-host-death family protein  50 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0044  prevent-host-death family protein  47.37 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3298  hypothetical protein  44.3 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1841  prevent-host-death protein  40.79 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208689  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16280  Prevent-host-death protein  43.75 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0407  prevent-host-death family protein  45.31 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.951779  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4634  prevent-host-death protein  38.36 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374921  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16060  putative antitoxin  72.97 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1208  prevent-host-death protein  37.5 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0337  prevent-host-death family protein  39.29 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.703493  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4765  prevent-host-death family protein  40.79 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01350  prevent-host-death family protein  34.18 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4877  prevent-host-death family protein  39.47 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5409  prevent-host-death family protein  39.47 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5287  prevent-host-death family protein  39.51 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0662178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3489  prevent-host-death protein  39.47 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00502392  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2448  prevent-host-death family protein  38.16 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0844  prevent-host-death protein  39.47 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0811736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0028  prevent-host-death protein  35.8 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0227799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4434  prevent-host-death family protein  38.75 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.318074  normal  0.388841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2940  hypothetical protein  36.71 
 
 		 94 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3814  putative YefM protein  39.24 
 
 		 84 aa  51.2  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000265887 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2972  prevent-host-death family protein  37.33 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.297792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3147  prevent-host-death family protein  37.33 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4120  hypothetical protein  39.74 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0989  prevent-host-death family protein  42.86 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1751  prevent-host-death protein  35.53 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0351  prevent-host-death family protein  38.03 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0975  prevent-host-death protein  35.44 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0832169  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1402  prevent-host-death family protein  35.44 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333938  normal  0.826973 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0554  antitoxin  36.71 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0694482  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15090  Phd_YefM  40.91 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.239627  normal  0.743101 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2432  prevent-host-death family protein  34.15 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2481  prevent-host-death family protein  32.89 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2433  prevent-host-death family protein  32.89 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2533  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000898748  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2484  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000069999  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4120  prevent-host-death family protein  37.88 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4160  prevent-host-death family protein  37.88 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.505447 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5458  prevent-host-death family protein  34.72 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2089  RelB  37.18 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.674522  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0433  prevent-host-death protein  27.27 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3905  prevent-host-death family protein  40.35 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.542624  normal  0.0844002 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>