31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4160 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_4120  prevent-host-death family protein  100 
 
 
72 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4160  prevent-host-death family protein  100 
 
 
72 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.505447 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2531  prevent-host-death family protein  39.39 
 
 
92 aa  57.4  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2039  prevent-host-death family protein  47.69 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.274153 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0311  prevent-host-death family protein  38.1 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2432  prevent-host-death family protein  42.42 
 
 
95 aa  50.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0407  prevent-host-death family protein  37.88 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.951779  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2087  prevent-host-death protein  36.36 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000757578  unclonable  0.0000000885843 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1639  prevent-host-death family protein  38.1 
 
 
83 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0329629  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2156  antitoxin YefM  38.1 
 
 
83 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2309  antitoxin YefM  38.1 
 
 
83 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.516264  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1214  antitoxin YefM  38.1 
 
 
83 aa  46.2  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01350  prevent-host-death family protein  35.38 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2555  prevent-host-death protein  37.88 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.29386  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0247  prevent-host-death family protein  33.87 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5287  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0662178  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4434  prevent-host-death family protein  35.82 
 
 
83 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.318074  normal  0.388841 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1841  prevent-host-death protein  36.21 
 
 
97 aa  43.9  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208689  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0351  prevent-host-death family protein  44 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0554  antitoxin  35.48 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0694482  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0794  prevent-host-death family protein  35.59 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1752  prevent-host-death family protein  40.32 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0588193 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5458  prevent-host-death family protein  36.92 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3814  putative YefM protein  37.1 
 
 
84 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000265887 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1402  prevent-host-death family protein  37.1 
 
 
84 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333938  normal  0.826973 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13393  hypothetical protein  37.5 
 
 
91 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.046844 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5885  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 
94 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5485  prevent-host-death protein  37.5 
 
 
94 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.822453 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0028  prevent-host-death protein  46.34 
 
 
86 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0227799  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4634  prevent-host-death protein  35.48 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374921  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1663  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0199822 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>