66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1208 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1208  prevent-host-death protein  100 
 
 
84 aa  171  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0975  prevent-host-death protein  67.47 
 
 
85 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0832169  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1402  prevent-host-death family protein  65.06 
 
 
84 aa  121  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333938  normal  0.826973 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0554  antitoxin  65.06 
 
 
83 aa  119  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0694482  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3814  putative YefM protein  63.86 
 
 
84 aa  118  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000265887 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2448  prevent-host-death family protein  61.9 
 
 
84 aa  113  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1308  prevent-host-death protein  63.86 
 
 
112 aa  113  8.999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5409  prevent-host-death family protein  60.49 
 
 
86 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0844  prevent-host-death protein  60.49 
 
 
86 aa  107  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0811736 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4877  prevent-host-death family protein  60.49 
 
 
86 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3489  prevent-host-death protein  60.49 
 
 
86 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00502392  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4765  prevent-host-death family protein  59.26 
 
 
86 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01044  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system, StbD family protein  62.69 
 
 
68 aa  95.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4120  hypothetical protein  44.58 
 
 
89 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0337  prevent-host-death family protein  48 
 
 
92 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.703493  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2940  hypothetical protein  45.68 
 
 
94 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2156  antitoxin YefM  42.17 
 
 
83 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0028  prevent-host-death protein  44.58 
 
 
86 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0227799  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2309  antitoxin YefM  42.17 
 
 
83 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.516264  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1214  antitoxin YefM  42.17 
 
 
83 aa  75.1  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1639  prevent-host-death family protein  42.17 
 
 
83 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0329629  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4023  prevent-host-death family protein  42.17 
 
 
84 aa  72  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4434  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 
83 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.318074  normal  0.388841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1845  hypothetical protein  41.98 
 
 
83 aa  71.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745967  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2432  prevent-host-death family protein  41.77 
 
 
95 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2293  prevent-host-death family protein  40.96 
 
 
83 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0178348 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1927  prevent-host-death family protein  40.96 
 
 
83 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00504779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0311  prevent-host-death family protein  41.33 
 
 
84 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1841  prevent-host-death protein  43.9 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208689  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0794  prevent-host-death family protein  39.76 
 
 
83 aa  68.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0247  prevent-host-death family protein  37.35 
 
 
83 aa  68.2  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01350  prevent-host-death family protein  38.55 
 
 
85 aa  67.4  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5458  prevent-host-death family protein  44.59 
 
 
74 aa  67.4  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2481  prevent-host-death family protein  37.04 
 
 
83 aa  67  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2433  prevent-host-death family protein  37.04 
 
 
83 aa  67  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4634  prevent-host-death protein  38.55 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374921  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5287  prevent-host-death family protein  39.02 
 
 
84 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0662178  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3147  prevent-host-death family protein  41.89 
 
 
78 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2972  prevent-host-death family protein  41.89 
 
 
78 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.297792 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3298  hypothetical protein  40.96 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1752  prevent-host-death family protein  42.67 
 
 
121 aa  63.9  0.0000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0588193 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2089  RelB  38.55 
 
 
84 aa  63.5  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.674522  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3587  prevent-host-death family protein  38.96 
 
 
96 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550844  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1751  prevent-host-death protein  36.59 
 
 
145 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3905  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 
83 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.542624  normal  0.0844002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0390  prevent-host-death family protein  38.67 
 
 
84 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5998  prevent-host-death protein:addiction module toxin, Txe/YoeB  49.02 
 
 
106 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16280  Prevent-host-death protein  44.78 
 
 
69 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2039  prevent-host-death family protein  40.58 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.274153 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1939  prevent-host-death family protein  34.57 
 
 
83 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3894  prevent-host-death family protein  34.94 
 
 
88 aa  57.4  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0407  prevent-host-death family protein  35.62 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.951779  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0351  prevent-host-death family protein  33.73 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2555  prevent-host-death protein  37.5 
 
 
85 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.29386  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0989  prevent-host-death family protein  38.55 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2531  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 
92 aa  54.3  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0433  prevent-host-death protein  32.53 
 
 
84 aa  52.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6160  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  33.33 
 
 
91 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2087  prevent-host-death protein  35.44 
 
 
95 aa  50.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000757578  unclonable  0.0000000885843 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14180  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 
82 aa  47  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.662389  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4301  prevent-host-death family protein  31.4 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0123254  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2906  prevent-host-death family protein  34.21 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1790  prevent-host-death family protein  30.77 
 
 
79 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7794  hypothetical protein  27.63 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2009  hypothetical protein  28.24 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0661805  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3885  prevent-host-death family protein  39.66 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>