76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_01350 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_01350  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 85 aa  167  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5458  prevent-host-death family protein  68.92 
 
 		 74 aa  105  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0247  prevent-host-death family protein  53.01 
 
 		 83 aa  99  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1214  antitoxin YefM  51.81 
 
 		 83 aa  94.4  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1639  prevent-host-death family protein  51.81 
 
 		 83 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0329629  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2156  antitoxin YefM  51.81 
 
 		 83 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2309  antitoxin YefM  51.81 
 
 		 83 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.516264  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0794  prevent-host-death family protein  51.81 
 
 		 83 aa  92  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1939  prevent-host-death family protein  49.4 
 
 		 83 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4023  prevent-host-death family protein  51.81 
 
 		 84 aa  91.3  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1845  hypothetical protein  53.01 
 
 		 83 aa  90.5  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0989  prevent-host-death family protein  62.35 
 
 		 94 aa  89.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1927  prevent-host-death family protein  48.19 
 
 		 83 aa  88.2  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00504779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2293  prevent-host-death family protein  46.99 
 
 		 83 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0178348 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4120  hypothetical protein  46.99 
 
 		 89 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3894  prevent-host-death family protein  47.06 
 
 		 88 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14180  prevent-host-death family protein  52.78 
 
 		 82 aa  80.1  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.662389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4634  prevent-host-death protein  46.99 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374921  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4434  prevent-host-death family protein  45.78 
 
 		 83 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.318074  normal  0.388841 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0351  prevent-host-death family protein  46.99 
 
 		 84 aa  79.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5287  prevent-host-death family protein  47.56 
 
 		 84 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0662178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1402  prevent-host-death family protein  43.37 
 
 		 84 aa  73.2  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333938  normal  0.826973 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1752  prevent-host-death family protein  47.95 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0588193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0390  prevent-host-death family protein  44.58 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0554  antitoxin  45.78 
 
 		 83 aa  70.1  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0694482  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1308  prevent-host-death protein  40.48 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3814  putative YefM protein  44.58 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000265887 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1841  prevent-host-death protein  40.24 
 
 		 97 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208689  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3905  prevent-host-death family protein  49.4 
 
 		 83 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.542624  normal  0.0844002 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1663  prevent-host-death family protein  42.86 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1208  prevent-host-death protein  38.55 
 
 		 84 aa  67.4  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16280  Prevent-host-death protein  46.38 
 
 		 69 aa  67  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2531  prevent-host-death family protein  40.74 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0311  prevent-host-death family protein  40.26 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4765  prevent-host-death family protein  41.18 
 
 		 86 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3489  prevent-host-death protein  40 
 
 		 86 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00502392  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5409  prevent-host-death family protein  40 
 
 		 86 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2089  RelB  37.35 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.674522  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4877  prevent-host-death family protein  40 
 
 		 86 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0028  prevent-host-death protein  40.96 
 
 		 86 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0227799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2087  prevent-host-death protein  42.03 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000757578  unclonable  0.0000000885843 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0844  prevent-host-death protein  39.51 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0811736 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2039  prevent-host-death family protein  41.56 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2432  prevent-host-death family protein  43.06 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4301  prevent-host-death family protein  40.91 
 
 		 84 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0123254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3298  hypothetical protein  41.18 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2940  hypothetical protein  38.27 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5485  prevent-host-death protein  45.21 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.822453 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5885  prevent-host-death family protein  45.21 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1751  prevent-host-death protein  34.12 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01044  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system, StbD family protein  41.79 
 
 		 68 aa  57  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0407  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.951779  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13393  hypothetical protein  42.47 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.046844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1790  prevent-host-death family protein  52.94 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0337  prevent-host-death family protein  36.49 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.703493  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2555  prevent-host-death protein  34.18 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.29386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3147  prevent-host-death family protein  29.33 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2972  prevent-host-death family protein  29.33 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.297792 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0975  prevent-host-death protein  32.94 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0832169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2448  prevent-host-death family protein  29.73 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2481  prevent-host-death family protein  34.29 
 
 		 83 aa  47.4  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2433  prevent-host-death family protein  34.29 
 
 		 83 aa  47.4  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4120  prevent-host-death family protein  35.38 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3587  prevent-host-death family protein  35.14 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4160  prevent-host-death family protein  35.38 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.505447 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6160  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  32.43 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2678  prevent-host-death protein  35.14 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00646262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5998  prevent-host-death protein:addiction module toxin, Txe/YoeB  36.21 
 
 		 106 aa  42.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3930  Axe family addiction module antitoxin  47.83 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1166  prevent-host-death family protein  40.74 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3828  addiction module antitoxin  47.83 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.899294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0433  prevent-host-death protein  28.4 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1941  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 95 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12881  hypothetical protein  30.51 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1789  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  36.92 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2009  hypothetical protein  25.58 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0661805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>