73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0028 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0028  prevent-host-death protein  100 
 
 		 86 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0227799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1927  prevent-host-death family protein  50.6 
 
 		 83 aa  87.4  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00504779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2293  prevent-host-death family protein  49.4 
 
 		 83 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0178348 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4023  prevent-host-death family protein  49.4 
 
 		 84 aa  82.4  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0794  prevent-host-death family protein  46.99 
 
 		 83 aa  80.1  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0247  prevent-host-death family protein  46.99 
 
 		 83 aa  80.1  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4634  prevent-host-death protein  50.6 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374921  normal  0.27831 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1639  prevent-host-death family protein  44.58 
 
 		 83 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0329629  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2156  antitoxin YefM  44.58 
 
 		 83 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2309  antitoxin YefM  44.58 
 
 		 83 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.516264  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1214  antitoxin YefM  44.58 
 
 		 83 aa  76.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1939  prevent-host-death family protein  45.78 
 
 		 83 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1208  prevent-host-death protein  44.58 
 
 		 84 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1308  prevent-host-death protein  49.4 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0311  prevent-host-death family protein  45.45 
 
 		 84 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1845  hypothetical protein  45.78 
 
 		 83 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1841  prevent-host-death protein  43.9 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208689  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1402  prevent-host-death family protein  45.78 
 
 		 84 aa  73.9  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333938  normal  0.826973 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3894  prevent-host-death family protein  45.78 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3814  putative YefM protein  44.58 
 
 		 84 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000265887 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0351  prevent-host-death family protein  42.17 
 
 		 84 aa  70.1  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5409  prevent-host-death family protein  43.02 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3489  prevent-host-death protein  43.02 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00502392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4877  prevent-host-death family protein  43.02 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5458  prevent-host-death family protein  45.95 
 
 		 74 aa  67.8  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4765  prevent-host-death family protein  41.86 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0844  prevent-host-death protein  43.21 
 
 		 86 aa  67  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0811736 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2432  prevent-host-death family protein  45.71 
 
 		 95 aa  67  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2940  hypothetical protein  41.98 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16280  Prevent-host-death protein  49.25 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4120  hypothetical protein  38.55 
 
 		 89 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3298  hypothetical protein  35.8 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5287  prevent-host-death family protein  40.24 
 
 		 84 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0662178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0975  prevent-host-death protein  39.76 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0832169  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01350  prevent-host-death family protein  40.96 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0554  antitoxin  39.76 
 
 		 83 aa  63.9  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0694482  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4434  prevent-host-death family protein  36.14 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.318074  normal  0.388841 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0433  prevent-host-death protein  37.04 
 
 		 84 aa  61.6  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2448  prevent-host-death family protein  36.25 
 
 		 84 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0337  prevent-host-death family protein  38.27 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.703493  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3905  prevent-host-death family protein  46.99 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.542624  normal  0.0844002 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0407  prevent-host-death family protein  43.75 
 
 		 87 aa  60.1  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.951779  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1751  prevent-host-death protein  40.54 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2089  RelB  36.14 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.674522  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01044  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system, StbD family protein  46.27 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1752  prevent-host-death family protein  45.07 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0588193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0390  prevent-host-death family protein  32.53 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2481  prevent-host-death family protein  35.06 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2433  prevent-host-death family protein  35.06 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2531  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13393  hypothetical protein  40.85 
 
 		 91 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.046844 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0989  prevent-host-death family protein  39.29 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5485  prevent-host-death protein  40.28 
 
 		 94 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.822453 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2555  prevent-host-death protein  35.8 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.29386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5885  prevent-host-death family protein  40.28 
 
 		 94 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1663  prevent-host-death family protein  38.46 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2009  hypothetical protein  30.95 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0661805  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2039  prevent-host-death family protein  36.23 
 
 		 95 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.274153 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4301  prevent-host-death family protein  36.05 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0123254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2087  prevent-host-death protein  31.94 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000757578  unclonable  0.0000000885843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3587  prevent-host-death family protein  35.14 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2972  prevent-host-death family protein  30.77 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.297792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3147  prevent-host-death family protein  30.77 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6160  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  33.33 
 
 		 91 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0044  prevent-host-death family protein  34.94 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4120  prevent-host-death family protein  46.34 
 
 		 72 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4160  prevent-host-death family protein  46.34 
 
 		 72 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.505447 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1101  prevent-host-death protein  30.34 
 
 		 90 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2120  prevent-host-death family protein  31.17 
 
 		 93 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000225731  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14180  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.662389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1787  prevent-host-death family protein  32.2 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3885  prevent-host-death family protein  42.11 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2964  prevent-host-death family protein  30.51 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>