60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12881 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12881  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  190  5e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2645  prevent-host-death family protein  48.35 
 
 
91 aa  98.2  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0238  prevent-host-death family protein  46.15 
 
 
91 aa  89  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.030686  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11273  hypothetical protein  44.19 
 
 
89 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00877977  hitchhiker  0.00820754 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0848  prevent-host-death family protein  44.05 
 
 
99 aa  80.5  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1941  prevent-host-death family protein  36.59 
 
 
95 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7794  hypothetical protein  36.05 
 
 
94 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1166  prevent-host-death family protein  34.44 
 
 
99 aa  63.5  0.0000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3587  prevent-host-death family protein  36.59 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550844  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2263  prevent-host-death family protein  33.82 
 
 
85 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4120  hypothetical protein  34.12 
 
 
89 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2964  prevent-host-death family protein  40 
 
 
80 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2678  prevent-host-death protein  32.43 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00646262  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1752  prevent-host-death family protein  40.28 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0588193 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1319  prevent-host-death family protein  29.55 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000582533  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2681  prevent-host-death family protein  28.92 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0623727  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0869  addiction module antitoxin, Axe family  37.14 
 
 
80 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0994  prevent-host-death family protein  37.14 
 
 
80 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000587691 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0989  prevent-host-death family protein  32.43 
 
 
94 aa  47  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2874  prevent-host-death family protein  34.07 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3171  prevent-host-death family protein  27.59 
 
 
85 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0044  prevent-host-death family protein  35.71 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27240  prevent-host-death family protein  31.25 
 
 
82 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00695261  normal  0.193392 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5409  prevent-host-death family protein  31.76 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0844  prevent-host-death protein  33.33 
 
 
86 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0811736 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4877  prevent-host-death family protein  31.76 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3489  prevent-host-death protein  31.76 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00502392  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2606  prevent-host-death family protein  39.06 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0351  prevent-host-death family protein  29.27 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0407  prevent-host-death family protein  30.43 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.951779  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1927  prevent-host-death family protein  28 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00504779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2293  prevent-host-death family protein  28 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0178348 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0458  prevent-host-death family protein  26.25 
 
 
93 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.159378  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1787  prevent-host-death family protein  40.35 
 
 
80 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4765  prevent-host-death family protein  30.59 
 
 
86 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0075  prevent-host-death family protein  37.88 
 
 
80 aa  43.5  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1308  prevent-host-death protein  28.95 
 
 
112 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0569  prevent-host-death family protein  28.75 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1402  prevent-host-death family protein  28.95 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333938  normal  0.826973 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3738  hypothetical protein  54.84 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3298  hypothetical protein  30 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3629  prevent-host-death family protein  31.71 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2479  prevent-host-death family protein  31.71 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1669  prevent-host-death family protein  28.75 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.103852 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0794  prevent-host-death family protein  29.73 
 
 
83 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2562  prevent-host-death family protein  24.14 
 
 
85 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0835616  normal  0.0155053 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2433  prevent-host-death family protein  27.5 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2481  prevent-host-death family protein  27.5 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041466  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01350  prevent-host-death family protein  30.51 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14180  prevent-host-death family protein  35.59 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.662389  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3814  putative YefM protein  29.33 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000265887 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2448  prevent-host-death family protein  28.36 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1042  prevent-host-death family protein  26.25 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.220339  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1954  prevent-host-death family protein  28.4 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1939  prevent-host-death family protein  27.71 
 
 
83 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2120  prevent-host-death family protein  28.09 
 
 
93 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000225731  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1443  prevent-host-death family protein  34.38 
 
 
80 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03335  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  28.4 
 
 
76 aa  40.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0678  prevent-host-death protein  26.19 
 
 
99 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.893582 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2906  prevent-host-death family protein  32.39 
 
 
87 aa  40  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>