42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1941 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1941  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 95 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0848  prevent-host-death family protein  46.15 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12881  hypothetical protein  37.36 
 
 		 93 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3587  prevent-host-death family protein  43.42 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2681  prevent-host-death family protein  43.96 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0623727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7794  hypothetical protein  38.37 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1166  prevent-host-death family protein  42.17 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11273  hypothetical protein  38.2 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00877977  hitchhiker  0.00820754 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2645  prevent-host-death family protein  39.29 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27240  prevent-host-death family protein  42.86 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00695261  normal  0.193392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2678  prevent-host-death protein  38.71 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00646262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0238  prevent-host-death family protein  35.71 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.030686  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0407  prevent-host-death family protein  38.81 
 
 		 87 aa  50.4  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.951779  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1939  prevent-host-death family protein  42.42 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0351  prevent-host-death family protein  32.43 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2136  prevent-host-death family protein  46.67 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.732701 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1162  prevent-host-death family protein  42.86 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203241  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2906  prevent-host-death family protein  40.32 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14180  prevent-host-death family protein  36.21 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.662389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1319  prevent-host-death family protein  32.94 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000582533  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1751  prevent-host-death protein  31.46 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3905  prevent-host-death family protein  31.03 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.542624  normal  0.0844002 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1770  prevent-host-death family protein  32.53 
 
 		 84 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3298  hypothetical protein  31.08 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1544  prevent-host-death family protein  47.17 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0311  prevent-host-death family protein  39.13 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0044  prevent-host-death family protein  31.34 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1496  prevent-host-death family protein  47.17 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0844897  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3797  hypothetical protein  47.92 
 
 		 62 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.731882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0994  prevent-host-death family protein  31.34 
 
 		 80 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000587691 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0869  addiction module antitoxin, Axe family  31.34 
 
 		 80 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0164  prevent-host-death family protein  36.23 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2120  prevent-host-death family protein  28.24 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000225731  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10272  hypothetical protein  39.66 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.102894 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01350  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2964  prevent-host-death family protein  29.85 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4765  prevent-host-death family protein  34.48 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2448  prevent-host-death family protein  25.33 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0794  prevent-host-death family protein  30.51 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02595  hypothetical protein  29.07 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5998  prevent-host-death protein:addiction module toxin, Txe/YoeB  34.62 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08246  prevent-host-death family protein  37.33 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>