53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1166 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1166  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 99 aa  194  3e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0848  prevent-host-death family protein  43.68 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3587  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7794  hypothetical protein  41.11 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12881  hypothetical protein  34.44 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11273  hypothetical protein  37.93 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00877977  hitchhiker  0.00820754 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2678  prevent-host-death protein  39.53 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00646262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27240  prevent-host-death family protein  42.67 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00695261  normal  0.193392 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0238  prevent-host-death family protein  36.14 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.030686  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1941  prevent-host-death family protein  53.06 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1423  prevent-host-death family protein  39.66 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00770487  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2645  prevent-host-death family protein  35.37 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2681  prevent-host-death family protein  37.8 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0623727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2163  prevent-host-death family protein  34.21 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2120  prevent-host-death family protein  32.18 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000225731  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2622  prevent-host-death family protein  30.68 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2906  prevent-host-death family protein  31.82 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1319  prevent-host-death family protein  28.41 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000582533  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2089  RelB  32.43 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.674522  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10272  hypothetical protein  43.86 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.102894 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02601  hypothetical protein  28.24 
 
 		 85 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1790  prevent-host-death family protein  40.68 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003261  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  28.24 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0351  prevent-host-death family protein  27.03 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0989  prevent-host-death family protein  37.97 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0225  prevent-host-death family protein  27.59 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1927  prevent-host-death family protein  35.82 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00504779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2293  prevent-host-death family protein  35.82 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0178348 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0862  hypothetical protein  34.43 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0184  prevent-host-death family protein  32.1 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549007 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0656  plasmid stabilization system antitoxin protein  25.58 
 
 		 87 aa  43.5  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0759  prevent-host-death family protein  25.58 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1752  prevent-host-death family protein  31.46 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0588193 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01350  prevent-host-death family protein  40.74 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2252  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000286584  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0758  hypothetical protein  27.27 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0850  hypothetical protein  27.27 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1939  prevent-host-death family protein  35.38 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1782  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2253  prevent-host-death family protein  29.21 
 
 		 93 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00900408  normal  0.987551 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2978  prevent-host-death family protein  28.24 
 
 		 91 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.453254  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0569  prevent-host-death family protein  28.75 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2448  prevent-host-death family protein  27.03 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2562  prevent-host-death family protein  28.24 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0835616  normal  0.0155053 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02595  hypothetical protein  32.79 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0390  prevent-host-death family protein  32.05 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3752  prevent-host-death family protein  56.52 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5458  prevent-host-death family protein  35.59 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3905  prevent-host-death family protein  34.78 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.542624  normal  0.0844002 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1669  prevent-host-death family protein  29.21 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.103852 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3171  prevent-host-death family protein  29.49 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02186  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  25.97 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0889095  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0915  prevent-host-death protein  34.85 
 
 		 74 aa  40  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.752928  normal  0.967689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>