45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3171 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3171  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 85 aa  171  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1747  prevent-host-death family protein  62.35 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2562  prevent-host-death family protein  62.35 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0835616  normal  0.0155053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4642  hypothetical protein  57.65 
 
 		 85 aa  114  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02186  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  57.65 
 
 		 85 aa  113  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0889095  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003261  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  57.65 
 
 		 85 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0850  hypothetical protein  57.65 
 
 		 85 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0758  hypothetical protein  57.65 
 
 		 85 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1782  prevent-host-death family protein  57.65 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0542  hypothetical phage-related protein  59.52 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.317857  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02601  hypothetical protein  56.47 
 
 		 85 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03335  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  73.68 
 
 		 76 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0458  prevent-host-death family protein  41.25 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.159378  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1042  prevent-host-death family protein  35 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.220339  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0678  prevent-host-death protein  38.75 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.893582 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1669  prevent-host-death family protein  33.75 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.103852 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0956  prevent-host-death protein  35 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.790427  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0532  prevent-host-death family protein  38.67 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0569  prevent-host-death family protein  31.17 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1048  prevent-host-death family protein  39.68 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2187  prevent-host-death family protein  39.68 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1400  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.917671  normal  0.977519 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2622  prevent-host-death family protein  30.67 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0656  plasmid stabilization system antitoxin protein  30.88 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0759  prevent-host-death family protein  30.88 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12881  hypothetical protein  27.59 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1319  prevent-host-death family protein  26.32 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000582533  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1353  prevent-host-death family protein  28.95 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.906372  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1423  prevent-host-death family protein  33.87 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00770487  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2751  ATPase  34.38 
 
 		 91 aa  44.3  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02595  hypothetical protein  30.56 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6553  prevent-host-death family protein  32 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00354401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2253  prevent-host-death family protein  31.25 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00900408  normal  0.987551 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2131  prevent-host-death family protein  35.71 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.905703  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1277  prevent-host-death protein  33.85 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5559  prevent-host-death family protein  33.75 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.199357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0411  prevent-host-death family protein  27.12 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0478215  normal  0.130855 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0125  addiction module antitoxin  37.18 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.17666e-21 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0862  hypothetical protein  29.58 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0682  prevent-host-death family protein  26.47 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1789  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  29.85 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1262  prevent-host-death family protein  27.69 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1166  prevent-host-death family protein  29.49 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2740  prevent-host-death family protein  36.49 
 
 		 87 aa  40  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0657903 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2438  prevent-host-death family protein  36.17 
 
 		 81 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0146525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>