46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1262 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1262  prevent-host-death family protein  100 
 
 
105 aa  215  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1277  prevent-host-death protein  65.52 
 
 
93 aa  120  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0569  prevent-host-death family protein  40.74 
 
 
87 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1669  prevent-host-death family protein  36.05 
 
 
92 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.103852 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0956  prevent-host-death protein  36.47 
 
 
93 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.790427  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0678  prevent-host-death protein  36.78 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.893582 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1042  prevent-host-death family protein  35.29 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.220339  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1048  prevent-host-death family protein  37.35 
 
 
92 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2187  prevent-host-death family protein  37.35 
 
 
92 aa  57.8  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0458  prevent-host-death family protein  33.71 
 
 
93 aa  57  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.159378  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13710  prevent-host-death family protein  35.8 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000922616  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1400  prevent-host-death family protein  31.03 
 
 
91 aa  54.7  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.917671  normal  0.977519 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0759  prevent-host-death family protein  29.63 
 
 
87 aa  54.3  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0656  plasmid stabilization system antitoxin protein  29.63 
 
 
87 aa  54.3  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1488  prevent-host-death family protein  29.49 
 
 
93 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2206  prevent-host-death family protein  30 
 
 
90 aa  50.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000169493  hitchhiker  0.00000000153827 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1690  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 
92 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0915  prevent-host-death protein  32.47 
 
 
74 aa  48.9  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.752928  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4124  prevent-host-death family protein  32.84 
 
 
90 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000234799  hitchhiker  0.00000000380976 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1455  prevent-host-death family protein  32.5 
 
 
88 aa  47.4  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1972  prevent-host-death family protein  29.11 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2751  ATPase  26.44 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2783  prevent-host-death family protein  36.62 
 
 
96 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.686877 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0867  prevent-host-death family protein  32.5 
 
 
95 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0951251 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2120  prevent-host-death family protein  31.88 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000225731  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0532  prevent-host-death family protein  23.53 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1789  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  23.81 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5559  prevent-host-death family protein  29.11 
 
 
93 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.199357  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02595  hypothetical protein  26.39 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3301  prevent-host-death family protein  38.24 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000616383  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0862  hypothetical protein  27.78 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2253  prevent-host-death family protein  27.63 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00900408  normal  0.987551 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0576  prevent-host-death family protein  24.39 
 
 
90 aa  44.3  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000390298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0628  prevent-host-death family protein  36.76 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000258599  unclonable  0.0000000000739074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0648  prevent-host-death family protein  36.76 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000197099  unclonable  0.0000000000981851 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0345  prevent-host-death family protein  45.45 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000320944  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0291  hypothetical protein  32.91 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1423  prevent-host-death family protein  26.39 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00770487  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02601  hypothetical protein  32.35 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2209  prevent-host-death family protein  35.29 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000546221  unclonable  0.0000000000598277 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2468  prevent-host-death family protein  30.88 
 
 
103 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4642  hypothetical protein  32.31 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02186  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  32.31 
 
 
85 aa  40.4  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0889095  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0682  prevent-host-death family protein  24.05 
 
 
89 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1353  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 
91 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.906372  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3171  prevent-host-death family protein  27.69 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>