47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1789 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1789  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  100 
 
 		 95 aa  193  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2751  ATPase  53.42 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1400  prevent-host-death family protein  52.05 
 
 		 91 aa  84  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.917671  normal  0.977519 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1488  prevent-host-death family protein  39.56 
 
 		 93 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2253  prevent-host-death family protein  38.04 
 
 		 93 aa  80.1  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00900408  normal  0.987551 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0682  prevent-host-death family protein  39.08 
 
 		 89 aa  79.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0532  prevent-host-death family protein  45.98 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6553  prevent-host-death family protein  42.05 
 
 		 93 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00354401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0678  prevent-host-death protein  38.64 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.893582 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5559  prevent-host-death family protein  40.91 
 
 		 93 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.199357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0458  prevent-host-death family protein  35.71 
 
 		 93 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.159378  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0759  prevent-host-death family protein  34.88 
 
 		 87 aa  72  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0956  prevent-host-death protein  34.52 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.790427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0656  plasmid stabilization system antitoxin protein  33.72 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0569  prevent-host-death family protein  37.78 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1669  prevent-host-death family protein  32.95 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.103852 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1042  prevent-host-death family protein  32.56 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.220339  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1048  prevent-host-death family protein  35.23 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2187  prevent-host-death family protein  35.23 
 
 		 92 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1277  prevent-host-death protein  28.92 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5451  prevent-host-death family protein  30.95 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.125011  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1279  prevent-host-death family protein  35.44 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2740  prevent-host-death family protein  44 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0657903 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1690  prevent-host-death family protein  26.83 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0915  prevent-host-death protein  36.54 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.752928  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1972  prevent-host-death family protein  25.32 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01562  Prevent-host-death protein  41.82 
 
 		 58 aa  47.8  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0862  hypothetical protein  26.74 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1423  prevent-host-death family protein  28.38 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00770487  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1262  prevent-host-death family protein  23.81 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0240  prevent-host-death family protein  32.56 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2696  prevent-host-death family protein  26.44 
 
 		 89 aa  43.5  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3301  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000616383  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003261  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  23.75 
 
 		 85 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2343  hypothetical protein  34.62 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1747  prevent-host-death family protein  23.38 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4642  hypothetical protein  25.37 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01350  prevent-host-death family protein  36.92 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2562  prevent-host-death family protein  26.25 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0835616  normal  0.0155053 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02601  hypothetical protein  25 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03335  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  26.76 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02186  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  25.37 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0889095  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3171  prevent-host-death family protein  29.85 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14180  prevent-host-death family protein  32.2 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.662389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02595  hypothetical protein  26.39 
 
 		 93 aa  40  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0850  hypothetical protein  25.37 
 
 		 85 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0758  hypothetical protein  25.37 
 
 		 85 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>