50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1488 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1488  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 93 aa  189  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6553  prevent-host-death family protein  60.47 
 
 		 93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00354401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5559  prevent-host-death family protein  55.91 
 
 		 93 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.199357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1400  prevent-host-death family protein  54.65 
 
 		 91 aa  107  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.917671  normal  0.977519 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2751  ATPase  52.33 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0759  prevent-host-death family protein  53.57 
 
 		 87 aa  97.4  5e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0532  prevent-host-death family protein  52.33 
 
 		 91 aa  96.7  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0682  prevent-host-death family protein  50 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0656  plasmid stabilization system antitoxin protein  52.38 
 
 		 87 aa  95.1  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2253  prevent-host-death family protein  48.91 
 
 		 93 aa  94.4  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00900408  normal  0.987551 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1669  prevent-host-death family protein  41.76 
 
 		 92 aa  88.6  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.103852 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0678  prevent-host-death protein  41.94 
 
 		 99 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.893582 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0956  prevent-host-death protein  39.56 
 
 		 93 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.790427  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1789  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  39.56 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0458  prevent-host-death family protein  38.2 
 
 		 93 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.159378  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1042  prevent-host-death family protein  38.1 
 
 		 93 aa  76.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.220339  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2187  prevent-host-death family protein  35.56 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1048  prevent-host-death family protein  35.56 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0569  prevent-host-death family protein  45.21 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1277  prevent-host-death protein  38.16 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2696  prevent-host-death family protein  44.59 
 
 		 89 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752077  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1353  prevent-host-death family protein  40.48 
 
 		 91 aa  62  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.906372  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2740  prevent-host-death family protein  41.86 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0657903 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1972  prevent-host-death family protein  31.4 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3421  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5451  prevent-host-death family protein  37.31 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.125011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1690  prevent-host-death family protein  30.23 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1262  prevent-host-death family protein  29.49 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0921  prevent-host-death family protein  35.62 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.387734  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0915  prevent-host-death protein  37.25 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.752928  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2343  hypothetical protein  32.05 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1423  prevent-host-death family protein  29.17 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00770487  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0862  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0576  prevent-host-death family protein  30.49 
 
 		 90 aa  46.2  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000390298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2206  prevent-host-death family protein  29.27 
 
 		 90 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000169493  hitchhiker  0.00000000153827 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2978  prevent-host-death family protein  30.14 
 
 		 91 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.453254  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4642  hypothetical protein  32.84 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02595  hypothetical protein  30.49 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2237  prevent-host-death family protein  29.49 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.265001  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0848  prevent-host-death family protein  43.06 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02186  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  31.34 
 
 		 85 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0889095  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1747  prevent-host-death family protein  29.23 
 
 		 85 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0850  hypothetical protein  31.34 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0758  hypothetical protein  31.34 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01562  Prevent-host-death protein  29.09 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1782  prevent-host-death family protein  31.34 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0240  prevent-host-death family protein  31.34 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3301  prevent-host-death family protein  32.84 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000616383  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2562  prevent-host-death family protein  30.88 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0835616  normal  0.0155053 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02601  hypothetical protein  31.34 
 
 		 85 aa  40  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>