38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2740 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2740  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 87 aa  172  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0657903 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1400  prevent-host-death family protein  51.72 
 
 		 91 aa  100  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.917671  normal  0.977519 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2751  ATPase  52.87 
 
 		 91 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0532  prevent-host-death family protein  55.17 
 
 		 91 aa  97.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6553  prevent-host-death family protein  49.43 
 
 		 93 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00354401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5559  prevent-host-death family protein  49.43 
 
 		 93 aa  87.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.199357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0656  plasmid stabilization system antitoxin protein  45 
 
 		 87 aa  84.7  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1669  prevent-host-death family protein  50.62 
 
 		 92 aa  83.6  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.103852 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0759  prevent-host-death family protein  46.67 
 
 		 87 aa  83.6  8e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0682  prevent-host-death family protein  41.25 
 
 		 89 aa  82.8  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2253  prevent-host-death family protein  48.05 
 
 		 93 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00900408  normal  0.987551 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1488  prevent-host-death family protein  41.86 
 
 		 93 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0956  prevent-host-death protein  52.94 
 
 		 93 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.790427  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1042  prevent-host-death family protein  52.94 
 
 		 93 aa  76.6  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.220339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0569  prevent-host-death family protein  46.75 
 
 		 87 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0678  prevent-host-death protein  50 
 
 		 99 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.893582 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2187  prevent-host-death family protein  50 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1048  prevent-host-death family protein  50 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0458  prevent-host-death family protein  47.83 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.159378  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5451  prevent-host-death family protein  39.73 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.125011  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1789  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  42.86 
 
 		 95 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08232  prevent-host-death family protein  34.15 
 
 		 89 aa  51.2  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000000278747  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0240  prevent-host-death family protein  39.02 
 
 		 83 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0862  hypothetical protein  37.88 
 
 		 97 aa  50.1  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1279  prevent-host-death family protein  32 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4645  prevent-host-death protein  35.37 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.547809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0125  addiction module antitoxin  36 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.17666e-21 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0177  prevent-host-death family protein  34.57 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2017  hypothetical protein  34.57 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02595  hypothetical protein  34.85 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1423  prevent-host-death family protein  37.04 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00770487  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3171  prevent-host-death family protein  36.49 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2237  prevent-host-death family protein  38.81 
 
 		 75 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.265001  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01562  Prevent-host-death protein  44.44 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03335  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  33.78 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2343  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1262  prevent-host-death family protein  26.25 
 
 		 105 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3587  prevent-host-death family protein  30.59 
 
 		 96 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550844  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>