65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0678 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0678  prevent-host-death protein  100 
 
 		 99 aa  200  6e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.893582 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0458  prevent-host-death family protein  68.82 
 
 		 93 aa  133  9e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.159378  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1042  prevent-host-death family protein  68.54 
 
 		 93 aa  130  6.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.220339  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1669  prevent-host-death family protein  66.29 
 
 		 92 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.103852 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2187  prevent-host-death family protein  68.54 
 
 		 92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1048  prevent-host-death family protein  68.54 
 
 		 92 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0956  prevent-host-death protein  61.96 
 
 		 93 aa  124  5e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.790427  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0569  prevent-host-death family protein  58.14 
 
 		 87 aa  110  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0532  prevent-host-death family protein  43.68 
 
 		 91 aa  83.6  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1488  prevent-host-death family protein  41.94 
 
 		 93 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1400  prevent-host-death family protein  41.49 
 
 		 91 aa  81.6  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.917671  normal  0.977519 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0759  prevent-host-death family protein  38.37 
 
 		 87 aa  80.1  0.000000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0656  plasmid stabilization system antitoxin protein  38.37 
 
 		 87 aa  79.3  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1789  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  38.64 
 
 		 95 aa  77.8  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2751  ATPase  37.78 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0682  prevent-host-death family protein  37.93 
 
 		 89 aa  77  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5559  prevent-host-death family protein  36.36 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.199357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6553  prevent-host-death family protein  36.36 
 
 		 93 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00354401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2253  prevent-host-death family protein  34.09 
 
 		 93 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00900408  normal  0.987551 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1423  prevent-host-death family protein  46.67 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00770487  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2740  prevent-host-death family protein  54 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0657903 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1262  prevent-host-death family protein  36.78 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1279  prevent-host-death family protein  32.91 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1277  prevent-host-death protein  40.85 
 
 		 93 aa  57  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2696  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1690  prevent-host-death family protein  36.67 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02601  hypothetical protein  35 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3171  prevent-host-death family protein  38.75 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0862  hypothetical protein  36.11 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1319  prevent-host-death family protein  32.14 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000582533  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4642  hypothetical protein  36.25 
 
 		 85 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2194  prevent-host-death family protein  32.1 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1353  prevent-host-death family protein  38.89 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.906372  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02186  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  35 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0889095  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1747  prevent-host-death family protein  33.75 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003261  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  33.75 
 
 		 85 aa  51.2  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0921  prevent-host-death family protein  34.52 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.387734  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1782  prevent-host-death family protein  33.75 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0758  hypothetical protein  33.75 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3421  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 		 91 aa  50.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0850  hypothetical protein  33.75 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2120  prevent-host-death family protein  40.68 
 
 		 93 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000225731  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5451  prevent-host-death family protein  33.82 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.125011  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0908  prevent-host-death protein  29.27 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00165129  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02595  hypothetical protein  30 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03335  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  41.54 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0542  hypothetical phage-related protein  34.78 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.317857  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08232  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000000278747  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2978  prevent-host-death family protein  30.95 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.453254  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0915  prevent-host-death protein  35.09 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.752928  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4124  prevent-host-death family protein  31.46 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000234799  hitchhiker  0.00000000380976 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2562  prevent-host-death family protein  35 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0835616  normal  0.0155053 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2237  prevent-host-death family protein  34.62 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.265001  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2343  hypothetical protein  31.65 
 
 		 77 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1972  prevent-host-death family protein  31.4 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2206  prevent-host-death family protein  26.44 
 
 		 90 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000169493  hitchhiker  0.00000000153827 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01562  Prevent-host-death protein  38.46 
 
 		 58 aa  44.3  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0125  addiction module antitoxin  29.49 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.17666e-21 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3301  prevent-host-death family protein  36.23 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000616383  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0240  prevent-host-death family protein  32.93 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2622  prevent-host-death family protein  27.5 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1455  prevent-host-death family protein  26.83 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04765  hypothetical protein  34.67 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0576  prevent-host-death family protein  23.26 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000390298  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12881  hypothetical protein  26.19 
 
 		 93 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>