31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2194 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2194  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 96 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0908  prevent-host-death protein  60.44 
 
 		 93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00165129  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1319  prevent-host-death family protein  31.03 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000582533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2622  prevent-host-death family protein  31.82 
 
 		 96 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0678  prevent-host-death protein  32.1 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.893582 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2187  prevent-host-death family protein  29.63 
 
 		 92 aa  50.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1048  prevent-host-death family protein  29.63 
 
 		 92 aa  50.8  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0569  prevent-host-death family protein  25.93 
 
 		 87 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1353  prevent-host-death family protein  32.86 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.906372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2978  prevent-host-death family protein  34.67 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.453254  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2696  prevent-host-death family protein  31.65 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0458  prevent-host-death family protein  27.27 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.159378  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0921  prevent-host-death family protein  35.14 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.387734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1423  prevent-host-death family protein  29.31 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00770487  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3421  prevent-host-death family protein  30.38 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0532  prevent-host-death family protein  30.38 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1042  prevent-host-death family protein  24.71 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.220339  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0542  hypothetical phage-related protein  33.33 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.317857  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0956  prevent-host-death protein  24.71 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.790427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0656  plasmid stabilization system antitoxin protein  25 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0759  prevent-host-death family protein  25 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0862  hypothetical protein  26.79 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1279  prevent-host-death family protein  30.23 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1669  prevent-host-death family protein  26.25 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.103852 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1747  prevent-host-death family protein  28.79 
 
 		 85 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0682  prevent-host-death family protein  26.19 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1972  prevent-host-death family protein  23.81 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0915  prevent-host-death protein  31.25 
 
 		 74 aa  40.8  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.752928  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02595  hypothetical protein  25 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3587  prevent-host-death family protein  30.36 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1400  prevent-host-death family protein  24.36 
 
 		 91 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.917671  normal  0.977519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>