39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1353 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1353  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 91 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.906372  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3421  prevent-host-death family protein  74.44 
 
 		 91 aa  146  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2696  prevent-host-death family protein  68.24 
 
 		 89 aa  123  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0921  prevent-host-death family protein  68.6 
 
 		 89 aa  120  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.387734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2978  prevent-host-death family protein  62.35 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.453254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1488  prevent-host-death family protein  40.48 
 
 		 93 aa  62  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0678  prevent-host-death protein  38.89 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.893582 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0862  hypothetical protein  31.4 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0458  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.159378  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2622  prevent-host-death family protein  28.4 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02595  hypothetical protein  32.93 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0532  prevent-host-death family protein  32.53 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1400  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.917671  normal  0.977519 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0908  prevent-host-death protein  31.51 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00165129  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0569  prevent-host-death family protein  36.11 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1423  prevent-host-death family protein  30 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00770487  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2194  prevent-host-death family protein  32.86 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0682  prevent-host-death family protein  34.62 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2187  prevent-host-death family protein  33.8 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1048  prevent-host-death family protein  33.8 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0956  prevent-host-death protein  35.29 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.790427  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1319  prevent-host-death family protein  27.78 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000582533  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1669  prevent-host-death family protein  32.86 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.103852 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1042  prevent-host-death family protein  32.86 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.220339  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2253  prevent-host-death family protein  29.17 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00900408  normal  0.987551 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2120  prevent-host-death family protein  32.5 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000225731  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3171  prevent-host-death family protein  28.95 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5559  prevent-host-death family protein  31.82 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.199357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0759  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6553  prevent-host-death family protein  30.68 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00354401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0656  plasmid stabilization system antitoxin protein  33.8 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1277  prevent-host-death protein  31.08 
 
 		 93 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0351  prevent-host-death family protein  32.89 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0915  prevent-host-death protein  39.13 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.752928  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2562  prevent-host-death family protein  28.95 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0835616  normal  0.0155053 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3587  prevent-host-death family protein  40.38 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1262  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1747  prevent-host-death family protein  25 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4642  hypothetical protein  28 
 
 		 85 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>