50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0682 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0682  prevent-host-death family protein  100 
 
 
89 aa  181  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0759  prevent-host-death family protein  57.47 
 
 
87 aa  116  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0656  plasmid stabilization system antitoxin protein  56.32 
 
 
87 aa  114  6e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1400  prevent-host-death family protein  51.19 
 
 
91 aa  105  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.917671  normal  0.977519 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2751  ATPase  51.19 
 
 
91 aa  99.4  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1488  prevent-host-death family protein  50 
 
 
93 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5559  prevent-host-death family protein  45.35 
 
 
93 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.199357  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6553  prevent-host-death family protein  46.34 
 
 
93 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00354401  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0532  prevent-host-death family protein  44.05 
 
 
91 aa  88.2  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2253  prevent-host-death family protein  37.93 
 
 
93 aa  81.6  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00900408  normal  0.987551 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0569  prevent-host-death family protein  43.02 
 
 
87 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1789  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  39.08 
 
 
95 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1042  prevent-host-death family protein  38.37 
 
 
93 aa  78.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.220339  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1669  prevent-host-death family protein  37.65 
 
 
92 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.103852 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0678  prevent-host-death protein  37.93 
 
 
99 aa  77  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.893582 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0956  prevent-host-death protein  38.82 
 
 
93 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.790427  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2187  prevent-host-death family protein  37.93 
 
 
92 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1048  prevent-host-death family protein  37.93 
 
 
92 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0458  prevent-host-death family protein  36.78 
 
 
93 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.159378  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2740  prevent-host-death family protein  41.25 
 
 
87 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0657903 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5451  prevent-host-death family protein  41.03 
 
 
92 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.125011  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1279  prevent-host-death family protein  35 
 
 
87 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2696  prevent-host-death family protein  35.44 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752077  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01562  Prevent-host-death protein  41.82 
 
 
58 aa  50.8  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2343  hypothetical protein  35 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554067  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1277  prevent-host-death protein  26.74 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1353  prevent-host-death family protein  34.62 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.906372  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0125  addiction module antitoxin  35.44 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  2.17666e-21 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0915  prevent-host-death protein  36.73 
 
 
74 aa  47.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.752928  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0240  prevent-host-death family protein  34.57 
 
 
83 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2237  prevent-host-death family protein  32.91 
 
 
75 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.265001  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0576  prevent-host-death family protein  30.67 
 
 
90 aa  47  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000390298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3421  prevent-host-death family protein  29.49 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1747  prevent-host-death family protein  29.41 
 
 
85 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1972  prevent-host-death family protein  25.64 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0862  hypothetical protein  27.85 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4645  prevent-host-death protein  32.1 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.547809  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08232  prevent-host-death family protein  28.21 
 
 
89 aa  43.5  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000000278747  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4124  prevent-host-death family protein  32 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000234799  hitchhiker  0.00000000380976 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1423  prevent-host-death family protein  25 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00770487  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1690  prevent-host-death family protein  24.39 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2194  prevent-host-death family protein  26.19 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2622  prevent-host-death family protein  25.97 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1455  prevent-host-death family protein  29.63 
 
 
88 aa  41.6  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03335  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  27.94 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1262  prevent-host-death family protein  24.05 
 
 
105 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3171  prevent-host-death family protein  26.47 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0177  prevent-host-death family protein  32.39 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2017  hypothetical protein  31.08 
 
 
85 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2206  prevent-host-death family protein  25.68 
 
 
90 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000169493  hitchhiker  0.00000000153827 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>