55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2751 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_2751  ATPase  100 
 
 
91 aa  184  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1400  prevent-host-death family protein  86.81 
 
 
91 aa  164  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.917671  normal  0.977519 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0532  prevent-host-death family protein  64.37 
 
 
91 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6553  prevent-host-death family protein  60.92 
 
 
93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00354401  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5559  prevent-host-death family protein  57.47 
 
 
93 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.199357  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0759  prevent-host-death family protein  54.76 
 
 
87 aa  103  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2253  prevent-host-death family protein  56.47 
 
 
93 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00900408  normal  0.987551 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1488  prevent-host-death family protein  52.33 
 
 
93 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0656  plasmid stabilization system antitoxin protein  53.57 
 
 
87 aa  100  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0682  prevent-host-death family protein  51.19 
 
 
89 aa  99.4  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1789  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  53.42 
 
 
95 aa  85.1  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2740  prevent-host-death family protein  52.87 
 
 
87 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0657903 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1669  prevent-host-death family protein  43.82 
 
 
92 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.103852 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0678  prevent-host-death protein  37.78 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.893582 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0956  prevent-host-death protein  46.67 
 
 
93 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.790427  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0458  prevent-host-death family protein  40.48 
 
 
93 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.159378  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2187  prevent-host-death family protein  40.48 
 
 
92 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1048  prevent-host-death family protein  40.48 
 
 
92 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1042  prevent-host-death family protein  40.48 
 
 
93 aa  73.6  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.220339  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0569  prevent-host-death family protein  44.59 
 
 
87 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5451  prevent-host-death family protein  38.82 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.125011  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1279  prevent-host-death family protein  33.72 
 
 
87 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0240  prevent-host-death family protein  34.15 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2343  hypothetical protein  35.44 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554067  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4645  prevent-host-death protein  32.93 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.547809  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3421  prevent-host-death family protein  31.65 
 
 
91 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1262  prevent-host-death family protein  26.44 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0850  hypothetical protein  30.49 
 
 
85 aa  46.2  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0758  hypothetical protein  30.49 
 
 
85 aa  46.2  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2696  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 
89 aa  46.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752077  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02186  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  30.49 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0889095  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1277  prevent-host-death protein  24.39 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1782  prevent-host-death family protein  30 
 
 
85 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2237  prevent-host-death family protein  32.91 
 
 
75 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.265001  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4642  hypothetical protein  30.49 
 
 
85 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01562  Prevent-host-death protein  46.15 
 
 
58 aa  45.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3171  prevent-host-death family protein  34.38 
 
 
85 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02601  hypothetical protein  30.43 
 
 
85 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0862  hypothetical protein  31.94 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1972  prevent-host-death family protein  26.25 
 
 
92 aa  43.9  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2622  prevent-host-death family protein  25.29 
 
 
96 aa  43.5  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3301  prevent-host-death family protein  41.18 
 
 
82 aa  43.9  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000616383  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03335  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  32.31 
 
 
76 aa  42.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4124  prevent-host-death family protein  34.15 
 
 
90 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000234799  hitchhiker  0.00000000380976 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0915  prevent-host-death protein  33.33 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.752928  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2562  prevent-host-death family protein  27.85 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0835616  normal  0.0155053 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1690  prevent-host-death family protein  27.5 
 
 
92 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003261  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  27.94 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0576  prevent-host-death family protein  27.5 
 
 
90 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000390298  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0177  prevent-host-death family protein  31.71 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1423  prevent-host-death family protein  26.14 
 
 
93 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00770487  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0542  hypothetical phage-related protein  27.54 
 
 
84 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.317857  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04765  hypothetical protein  29.33 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2017  hypothetical protein  28.05 
 
 
85 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1747  prevent-host-death family protein  30.77 
 
 
85 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>