60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1042 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1042  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 93 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.220339  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1669  prevent-host-death family protein  83.33 
 
 		 92 aa  157  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.103852 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0956  prevent-host-death protein  83.33 
 
 		 93 aa  155  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.790427  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1048  prevent-host-death family protein  69.57 
 
 		 92 aa  141  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2187  prevent-host-death family protein  69.57 
 
 		 92 aa  141  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0458  prevent-host-death family protein  67.39 
 
 		 93 aa  131  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.159378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0678  prevent-host-death protein  68.54 
 
 		 99 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.893582 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0569  prevent-host-death family protein  56.98 
 
 		 87 aa  110  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0759  prevent-host-death family protein  46.51 
 
 		 87 aa  89.4  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0656  plasmid stabilization system antitoxin protein  46.51 
 
 		 87 aa  88.2  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0532  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 		 91 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0682  prevent-host-death family protein  38.37 
 
 		 89 aa  78.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1400  prevent-host-death family protein  39.29 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.917671  normal  0.977519 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1488  prevent-host-death family protein  38.1 
 
 		 93 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2751  ATPase  40.48 
 
 		 91 aa  73.6  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2253  prevent-host-death family protein  37.21 
 
 		 93 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00900408  normal  0.987551 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1789  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  32.56 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6553  prevent-host-death family protein  37.04 
 
 		 93 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00354401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5559  prevent-host-death family protein  35.23 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.199357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1277  prevent-host-death protein  38.27 
 
 		 93 aa  61.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2740  prevent-host-death family protein  52.94 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0657903 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02186  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  34.94 
 
 		 85 aa  60.1  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0889095  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0758  hypothetical protein  34.94 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0850  hypothetical protein  34.94 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1279  prevent-host-death family protein  30.23 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1262  prevent-host-death family protein  35.29 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02601  hypothetical protein  33.73 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4642  hypothetical protein  33.73 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1782  prevent-host-death family protein  33.73 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0862  hypothetical protein  36.11 
 
 		 97 aa  57  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003261  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  33.73 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3171  prevent-host-death family protein  35 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1423  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00770487  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0125  addiction module antitoxin  37.18 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.17666e-21 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02595  hypothetical protein  33.33 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5451  prevent-host-death family protein  34.72 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.125011  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2562  prevent-host-death family protein  32.53 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0835616  normal  0.0155053 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1747  prevent-host-death family protein  32.5 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1690  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03335  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  39.68 
 
 		 76 aa  50.4  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2696  prevent-host-death family protein  31.65 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0542  hypothetical phage-related protein  33.33 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.317857  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0915  prevent-host-death protein  34.62 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.752928  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2194  prevent-host-death family protein  24.71 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2343  hypothetical protein  32.93 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1972  prevent-host-death family protein  30.95 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2120  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000225731  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01562  Prevent-host-death protein  37.04 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3421  prevent-host-death family protein  32.05 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000897234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1353  prevent-host-death family protein  32.86 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.906372  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1319  prevent-host-death family protein  26.25 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000582533  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0908  prevent-host-death protein  25.35 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00165129  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2622  prevent-host-death family protein  29.17 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0576  prevent-host-death family protein  30.38 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000390298  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2237  prevent-host-death family protein  30.86 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.265001  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04765  hypothetical protein  35.37 
 
 		 80 aa  41.2  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08232  prevent-host-death family protein  40.54 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.000000000278747  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12881  hypothetical protein  26.25 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2206  prevent-host-death family protein  28.4 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000169493  hitchhiker  0.00000000153827 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1455  prevent-host-death family protein  25.88 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>