42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2562 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2562  prevent-host-death family protein  100 
 
 
85 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0835616  normal  0.0155053 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1782  prevent-host-death family protein  74.12 
 
 
85 aa  138  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003261  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  74.12 
 
 
85 aa  137  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02601  hypothetical protein  74.12 
 
 
85 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02186  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  70.59 
 
 
85 aa  134  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0889095  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4642  hypothetical protein  70.59 
 
 
85 aa  134  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0850  hypothetical protein  70.59 
 
 
85 aa  134  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0758  hypothetical protein  70.59 
 
 
85 aa  134  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0542  hypothetical phage-related protein  71.43 
 
 
84 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.317857  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1747  prevent-host-death family protein  64.71 
 
 
85 aa  123  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3171  prevent-host-death family protein  62.35 
 
 
85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03335  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  59.21 
 
 
76 aa  94.7  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0458  prevent-host-death family protein  38.55 
 
 
93 aa  60.1  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.159378  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2187  prevent-host-death family protein  36.25 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1048  prevent-host-death family protein  36.25 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1669  prevent-host-death family protein  34.94 
 
 
92 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.103852 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1042  prevent-host-death family protein  32.53 
 
 
93 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.220339  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0532  prevent-host-death family protein  38.36 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.643414  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0956  prevent-host-death protein  33.78 
 
 
93 aa  48.9  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.790427  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0678  prevent-host-death protein  35 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.893582 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0569  prevent-host-death family protein  30 
 
 
87 aa  47  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02595  hypothetical protein  27.71 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1400  prevent-host-death family protein  30.88 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.917671  normal  0.977519 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0862  hypothetical protein  27.38 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6553  prevent-host-death family protein  34.67 
 
 
93 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00354401  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0576  prevent-host-death family protein  38.1 
 
 
90 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000390298  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0656  plasmid stabilization system antitoxin protein  29.63 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0759  prevent-host-death family protein  29.63 
 
 
87 aa  45.1  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1423  prevent-host-death family protein  32.26 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00770487  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1319  prevent-host-death family protein  28 
 
 
94 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000582533  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5559  prevent-host-death family protein  34.94 
 
 
93 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.199357  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2622  prevent-host-death family protein  29.33 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2253  prevent-host-death family protein  28.05 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00900408  normal  0.987551 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2751  ATPase  27.85 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12881  hypothetical protein  24.14 
 
 
93 aa  42  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1166  prevent-host-death family protein  28.24 
 
 
99 aa  41.2  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2206  prevent-host-death family protein  34.92 
 
 
90 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000169493  hitchhiker  0.00000000153827 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1277  prevent-host-death protein  32.84 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.913531 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1353  prevent-host-death family protein  28.95 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.906372  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1789  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  26.25 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2120  prevent-host-death family protein  28.12 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000225731  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1488  prevent-host-death family protein  30.88 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>