21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1790 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1790  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 79 aa  154  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01350  prevent-host-death family protein  52.94 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5458  prevent-host-death family protein  43.28 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0337  prevent-host-death family protein  30.26 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.703493  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1166  prevent-host-death family protein  40.68 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14180  prevent-host-death family protein  43.4 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.662389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0238  prevent-host-death family protein  33.8 
 
 		 91 aa  45.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.030686  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0351  prevent-host-death family protein  32 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1402  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333938  normal  0.826973 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1752  prevent-host-death family protein  36 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0588193 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2940  hypothetical protein  31.15 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3814  putative YefM protein  32 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000265887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1927  prevent-host-death family protein  37.25 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00504779  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0554  antitoxin  29.49 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0694482  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2293  prevent-host-death family protein  37.25 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0178348 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3905  prevent-host-death family protein  31.37 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.542624  normal  0.0844002 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1208  prevent-host-death protein  30.77 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0390  prevent-host-death family protein  30.67 
 
 		 84 aa  40.4  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2089  RelB  32.79 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.674522  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3587  prevent-host-death family protein  29.58 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7794  hypothetical protein  31.67 
 
 		 94 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>