42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11273 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11273  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  175  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00877977  hitchhiker  0.00820754 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0238  prevent-host-death family protein  51.16 
 
 
91 aa  84  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.030686  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12881  hypothetical protein  44.19 
 
 
93 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0848  prevent-host-death family protein  49.4 
 
 
99 aa  78.2  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.604068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2645  prevent-host-death family protein  45.35 
 
 
91 aa  77  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2678  prevent-host-death protein  45.12 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00646262  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7794  hypothetical protein  46.34 
 
 
94 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3587  prevent-host-death family protein  42.68 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550844  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1166  prevent-host-death family protein  37.93 
 
 
99 aa  62.8  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2681  prevent-host-death family protein  42.17 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0623727  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27240  prevent-host-death family protein  40 
 
 
82 aa  58.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00695261  normal  0.193392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1941  prevent-host-death family protein  37.8 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2606  prevent-host-death family protein  42.86 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1319  prevent-host-death family protein  26.44 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000582533  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0075  prevent-host-death family protein  39.71 
 
 
80 aa  47  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2964  prevent-host-death family protein  37.14 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1751  prevent-host-death protein  32.43 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1787  prevent-host-death family protein  38.24 
 
 
80 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2120  prevent-host-death family protein  28.21 
 
 
93 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000225731  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02601  hypothetical protein  28.74 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0044  prevent-host-death family protein  35.71 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1402  prevent-host-death family protein  32 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333938  normal  0.826973 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2622  prevent-host-death family protein  25.29 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2293  prevent-host-death family protein  30.67 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0178348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0869  addiction module antitoxin, Axe family  34.29 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0994  prevent-host-death family protein  34.29 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000587691 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1927  prevent-host-death family protein  30.67 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00504779  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2448  prevent-host-death family protein  29.87 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1443  prevent-host-death protein  41.33 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.907457  normal  0.0368823 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0407  prevent-host-death family protein  31.88 
 
 
87 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.951779  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2263  prevent-host-death family protein  35.29 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0351  prevent-host-death family protein  26.83 
 
 
84 aa  41.2  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003261  antitoxin of toxin-antitoxin stability system  28.74 
 
 
85 aa  41.2  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0452  prevent-host-death protein  62.16 
 
 
91 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.395631 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1639  prevent-host-death family protein  29.27 
 
 
83 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0329629  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0758  hypothetical protein  28.74 
 
 
85 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0850  hypothetical protein  28.74 
 
 
85 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1214  antitoxin YefM  29.27 
 
 
83 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2309  antitoxin YefM  29.27 
 
 
83 aa  40.8  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.516264  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2156  antitoxin YefM  29.27 
 
 
83 aa  40.8  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4023  prevent-host-death family protein  30.88 
 
 
84 aa  40.8  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0862  hypothetical protein  26.44 
 
 
97 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>