37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5883 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5883  prevent-host-death family protein  100 
 
 
79 aa  157  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.635627 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0090  prevent-host-death protein  75 
 
 
80 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3345  prevent-host-death protein  72.06 
 
 
92 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.408445  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3378  prevent-host-death family protein  65 
 
 
83 aa  103  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185106  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3078  prevent-host-death protein  70.59 
 
 
80 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.018345  normal  0.547068 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0140  prevent-host-death family protein  62.65 
 
 
83 aa  101  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2530  prevent-host-death protein  55.56 
 
 
69 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0575  prevent-host-death protein  45.45 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103149  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4285  hypothetical protein  50 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192464  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  44.44 
 
 
93 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0623  prevent-host-death protein  40.91 
 
 
94 aa  50.8  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4580  prevent-host-death family protein  45 
 
 
88 aa  50.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4537  prevent-host-death family protein  48.33 
 
 
88 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0623765 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5092  prevent-host-death family protein  47.54 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5263  prevent-host-death family protein  45 
 
 
88 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416232  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0714  prevent-host-death family protein  47.92 
 
 
93 aa  47.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667491  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4514  prevent-host-death protein  44.26 
 
 
91 aa  47  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.680635  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  32.91 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  31.65 
 
 
85 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1595  prevent-host-death family protein  43.48 
 
 
77 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1545  prevent-host-death family protein  62.16 
 
 
83 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0610956  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2085  prevent-host-death family protein  41.18 
 
 
86 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2340  prevent-host-death family protein  32.93 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3527  prevent-host-death family protein  50 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378115  normal  0.865399 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1710  prevent-host-death protein  50 
 
 
90 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6403  prevent-host-death family protein  50 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4711  prevent-host-death family protein  40.3 
 
 
86 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1697  prevent-host-death family protein  43.48 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000276102  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3797  hypothetical protein  39.58 
 
 
62 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.731882  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1212  prevent-host-death family protein  42.22 
 
 
101 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.985049  normal  0.376618 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4183  prevent-host-death family protein  58.06 
 
 
83 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3332  prevent-host-death family protein  58.06 
 
 
83 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4834  prevent-host-death protein  58.06 
 
 
83 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3569  prevent-host-death family protein  40.43 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4748  prevent-host-death family protein  43.14 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4337  prevent-host-death protein  48.89 
 
 
77 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.574582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0546  prevent-host-death family protein  39.58 
 
 
68 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.241821  normal  0.749845 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>