34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3527 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3527  prevent-host-death family protein  100 
 
 
82 aa  164  5e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378115  normal  0.865399 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1710  prevent-host-death protein  85.37 
 
 
90 aa  142  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0575  prevent-host-death protein  47.62 
 
 
80 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103149  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2038  prevent-host-death family protein  46.55 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2929  prevent-host-death family protein  63.41 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.106644 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3345  prevent-host-death protein  53.33 
 
 
92 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.408445  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3078  prevent-host-death protein  53.33 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.018345  normal  0.547068 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0090  prevent-host-death protein  40.24 
 
 
80 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1777  prevent-host-death family protein  53.66 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.041895 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0140  prevent-host-death family protein  39.51 
 
 
83 aa  45.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3378  prevent-host-death family protein  39.02 
 
 
83 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185106  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4105  hypothetical protein  35.9 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4380  prevent-host-death family protein  53.66 
 
 
76 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5883  prevent-host-death family protein  50 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.635627 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4551  prevent-host-death family protein  56.1 
 
 
80 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0061  prevent-host-death family protein  47.73 
 
 
93 aa  44.3  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.933415  normal  0.536193 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1545  prevent-host-death family protein  44.59 
 
 
83 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0610956  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2469  prevent-host-death family protein  40 
 
 
96 aa  43.5  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117875  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1204  prevent-host-death protein  36.23 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760052  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1844  prevent-host-death family protein  40.38 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0046  prevent-host-death family protein  43.14 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.41963  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0065  prevent-host-death family protein  43.14 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0024  prevent-host-death protein  43.14 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0775  prevent-host-death protein  44.44 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99719  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2085  prevent-host-death family protein  35.37 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1433  prevent-host-death protein  51.35 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.205341  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3886  prevent-host-death family protein  46.15 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1318  prevent-host-death family protein  46.15 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.404403  normal  0.571647 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2762  prevent-host-death family protein  39.13 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.954217  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  39.29 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1186  prevent-host-death family protein  51.22 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0748873  normal  0.669167 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31860  Prevent-host-death family protein  50 
 
 
81 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2530  prevent-host-death protein  48.94 
 
 
69 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2423  prevent-host-death protein  40 
 
 
82 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>