32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1595 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1595  prevent-host-death family protein  100 
 
 		 77 aa  160  6e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1697  prevent-host-death family protein  97.26 
 
 		 82 aa  148  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000276102  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0714  prevent-host-death family protein  50.67 
 
 		 93 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667491  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2340  prevent-host-death family protein  45.45 
 
 		 82 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0012  prevent-host-death protein  46.58 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93374 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0872  hypothetical protein  44.12 
 
 		 83 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.653193  normal  0.0282611 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4711  prevent-host-death family protein  43.94 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0623  prevent-host-death protein  38.67 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0506  hypothetical protein  45.21 
 
 		 93 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4285  hypothetical protein  43.06 
 
 		 92 aa  57  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192464  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5092  prevent-host-death family protein  38.16 
 
 		 112 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4537  prevent-host-death family protein  39.47 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0623765 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4580  prevent-host-death family protein  41.67 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.564565  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5263  prevent-host-death family protein  39.47 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6276  prevent-host-death family protein  48 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2538  prevent-host-death family protein  48 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.91328 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4542  prevent-host-death family protein  34.12 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1822  prevent-host-death family protein  36.36 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.307814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1603  prevent-host-death protein  46.67 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.916276  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3421  prevent-host-death family protein  44.19 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.985918 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5883  prevent-host-death family protein  43.48 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.635627 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2918  prevent-host-death family protein  47.62 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0140  prevent-host-death family protein  44.44 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1401  prevent-host-death family protein  36.99 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.489676 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4514  prevent-host-death protein  33.78 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.680635  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3961  prevent-host-death family protein  32.61 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.986483  normal  0.184191 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3378  prevent-host-death family protein  45.65 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185106  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3828  addiction module antitoxin  35.29 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.899294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3930  Axe family addiction module antitoxin  35.29 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2874  prevent-host-death family protein  37.04 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0090  prevent-host-death protein  46 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2535  prevent-host-death protein  33.33 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.784194  normal  0.833179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>