96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2770 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2770  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  487  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124762  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2504  putative lipoprotein  90.42 
 
 		 240 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3094  hypothetical protein  92.92 
 
 		 240 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518827  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2628  hypothetical protein  92.92 
 
 		 240 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.189737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4959  hypothetical protein  60.52 
 
 		 251 aa  290  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.261667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2265  putative lipoprotein  42.86 
 
 		 181 aa  152  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01967  putative transmembrane protein  32.69 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77679  normal  0.402218 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1180  putative type VI secretion protein VasD-1  29.09 
 
 		 154 aa  72  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0234801  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0101  hypothetical protein  30.82 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000013  type VI secretion lipoprotein/VasD  30.94 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2179  putative lipoprotein  34.13 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000218689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0166  hypothetical protein  39.6 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3647  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0185188  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3638  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00119915  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3663  putative lipoprotein  34.67 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353625  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0443  hypothetical protein  36.67 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  0.490833 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3557  hypothetical protein  36.67 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0566246  normal  0.386059 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0465  hypothetical protein  36.67 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.144688  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2932  hypothetical protein  39.8 
 
 		 203 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.147593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0379  hypothetical protein  41.05 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0510591  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2641  hypothetical protein  36.67 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212724  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2966  hypothetical protein  32.19 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4911  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  33.54 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000403231  hitchhiker  0.009082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26740  hypothetical protein  31.06 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251057  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0400  hypothetical protein  40 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000206514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5580  putative lipoprotein  29.25 
 
 		 166 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3243  hypothetical protein  27.92 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.795372  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5421  lipoprotein, putative  31.68 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3606  putative lipoprotein  33.67 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42940  putative lipoprotein  33.67 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.177757 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0396  putative lipoprotein  27.65 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5275  hypothetical protein  29.34 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.174651  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1208  putative lipoprotein  27.65 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1525  hypothetical protein  26.28 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1590  putative lipoprotein  28.19 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1775  putative lipoprotein  28.19 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0409935  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2968  putative lipoprotein  28.19 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2843  putative lipoprotein  28.19 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0445  putative lipoprotein  28.19 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0306  type VI secretion lipoprotein  26.9 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.157499  normal  0.0453584 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0318  type VI secretion lipoprotein, family  26.9 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0341521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2376  hypothetical protein  29.47 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6111  hypothetical protein  27.04 
 
 		 168 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24398 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1595  hypothetical protein  26.97 
 
 		 171 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0312  type VI secretion lipoprotein, family  27.48 
 
 		 163 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.544183 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0301  SciN protein  27.48 
 
 		 163 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.589759 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2091  hypothetical protein  28.03 
 
 		 156 aa  53.9  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2551  hypothetical protein  30.53 
 
 		 163 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273704  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1105  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  27.94 
 
 		 177 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3659  hypothetical protein  27.21 
 
 		 172 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177991  normal  0.259907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0552  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  32.99 
 
 		 171 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02043  lipoprotein, putative  28.26 
 
 		 202 aa  53.1  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0637  hypothetical protein  28.57 
 
 		 189 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0051  hypothetical protein  34.58 
 
 		 190 aa  52.8  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3025  putative lipoprotein  27.75 
 
 		 180 aa  52.4  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2523  hypothetical protein  28.45 
 
 		 176 aa  52  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2585  hypothetical protein  26.49 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.788173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2808  hypothetical protein  31.18 
 
 		 154 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000258047  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2995  hypothetical protein  26.49 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000478166 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1802  hypothetical protein  29.25 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.56234  normal  0.0484163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1202  hypothetical protein  24.68 
 
 		 163 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2487  hypothetical protein  26.49 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1224  type VI secretion lipoprotein family protein  27.21 
 
 		 177 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.804985 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0234  type VI secretion lipoprotein  24.64 
 
 		 174 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1116  putative type VI secretion protein VasD  22.86 
 
 		 162 aa  49.3  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0251  putative lipoprotein  30.68 
 
 		 172 aa  49.3  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0240  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  23.91 
 
 		 174 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0232  type VI secretion lipoprotein  23.91 
 
 		 174 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3843  putative lipoprotein  29.37 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00099713  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0802  hypothetical protein  25.83 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3249  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  25.52 
 
 		 173 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0210  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  22.16 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00960  putative lipoprotein  28.97 
 
 		 154 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0194597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3727  hypothetical protein  25.37 
 
 		 177 aa  47  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1912  hypothetical protein  28.95 
 
 		 167 aa  45.4  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0925  hypothetical protein  28.95 
 
 		 167 aa  45.4  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1076  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  23.81 
 
 		 174 aa  45.4  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.556943  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3484  hypothetical protein  31.88 
 
 		 150 aa  45.8  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.764969  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0983  hypothetical protein  27.69 
 
 		 167 aa  45.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3128  hypothetical protein  31.88 
 
 		 150 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0000351189  normal  0.204022 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2187  SciN protein  28.95 
 
 		 167 aa  45.4  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1212  hypothetical protein  28.95 
 
 		 167 aa  45.4  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.822471  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0151  putative lipoprotein  28.97 
 
 		 154 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2319  hypothetical protein  31.03 
 
 		 155 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00471412  hitchhiker  0.00131937 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0025  putative lipoprotein  27.55 
 
 		 158 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.567085  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0937  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  26.32 
 
 		 170 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0392  putative lipoprotein  29.29 
 
 		 181 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2801  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  28.06 
 
 		 178 aa  43.1  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0319  putative lipoprotein  29.29 
 
 		 181 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0124  putative lipoprotein  24.71 
 
 		 180 aa  42.7  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2467  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  31 
 
 		 164 aa  42.7  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000431  type VI secretion lipoprotein/VasD  23.57 
 
 		 166 aa  42.4  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1470  putative lipoprotein  28.83 
 
 		 187 aa  42.4  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.513143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05853  hypothetical protein  25.74 
 
 		 149 aa  42.4  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6676  putative lipoprotein  28.8 
 
 		 179 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.974139 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0137  SciN protein  24.71 
 
 		 180 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>