106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6111 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6111  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  341  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.24398 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0983  hypothetical protein  61.31 
 
 
167 aa  218  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2090  putative outer membrane lipoprotein  65.45 
 
 
166 aa  217  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0937  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  63.31 
 
 
170 aa  214  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731961  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3910  hypothetical protein  56.89 
 
 
167 aa  202  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374434  normal  0.782471 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3477  hypothetical protein  60.71 
 
 
168 aa  198  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1912  hypothetical protein  66.43 
 
 
167 aa  190  9e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0925  hypothetical protein  66.43 
 
 
167 aa  190  9e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1212  hypothetical protein  66.43 
 
 
167 aa  190  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.822471  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2187  SciN protein  66.43 
 
 
167 aa  190  9e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1692  putative lipoprotein  65.73 
 
 
167 aa  178  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.794584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0330  SciN protein  65.73 
 
 
167 aa  178  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0239  SciN protein  65.73 
 
 
167 aa  178  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0306  type VI secretion lipoprotein  53.12 
 
 
163 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.157499  normal  0.0453584 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0318  type VI secretion lipoprotein, family  53.12 
 
 
163 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0341521  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0312  type VI secretion lipoprotein, family  53.12 
 
 
163 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.544183 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0301  SciN protein  53.12 
 
 
163 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.589759 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1676  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  48.67 
 
 
172 aa  147  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.973088  hitchhiker  0.0062275 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6676  putative lipoprotein  45.45 
 
 
179 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.974139 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0124  putative lipoprotein  42.67 
 
 
180 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3025  putative lipoprotein  43.14 
 
 
180 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0160  SciN protein  41.29 
 
 
210 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0137  SciN protein  41.29 
 
 
180 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00960  putative lipoprotein  49.18 
 
 
154 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0194597  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0151  putative lipoprotein  49.18 
 
 
154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0210  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  38 
 
 
156 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0101  hypothetical protein  45.74 
 
 
160 aa  104  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0396  putative lipoprotein  35.67 
 
 
179 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1208  putative lipoprotein  35.67 
 
 
191 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1590  putative lipoprotein  35.67 
 
 
172 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1775  putative lipoprotein  35.67 
 
 
172 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0409935  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2968  putative lipoprotein  35.67 
 
 
172 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2843  putative lipoprotein  35.67 
 
 
172 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0445  putative lipoprotein  35.67 
 
 
172 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42940  putative lipoprotein  48.57 
 
 
168 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.177757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3606  putative lipoprotein  48.57 
 
 
168 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26740  hypothetical protein  36.17 
 
 
192 aa  101  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251057  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1595  hypothetical protein  36.77 
 
 
171 aa  99.8  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4054  hypothetical protein  40.48 
 
 
197 aa  99.4  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000378046 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5421  lipoprotein, putative  43.33 
 
 
166 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5580  putative lipoprotein  39.66 
 
 
166 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0552  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  34.73 
 
 
171 aa  96.7  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0251  putative lipoprotein  35.04 
 
 
172 aa  94.4  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2319  hypothetical protein  41.94 
 
 
155 aa  94  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00471412  hitchhiker  0.00131937 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000013  type VI secretion lipoprotein/VasD  35.9 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3843  putative lipoprotein  33.33 
 
 
199 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00099713  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2551  hypothetical protein  42 
 
 
163 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273704  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1470  putative lipoprotein  35.29 
 
 
187 aa  85.9  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.513143  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2376  hypothetical protein  30.58 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2997  putative lipoprotein  35.88 
 
 
176 aa  79  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05853  hypothetical protein  31.88 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1116  putative type VI secretion protein VasD  28.03 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1482  hypothetical protein  29.01 
 
 
186 aa  73.9  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000431  type VI secretion lipoprotein/VasD  30.15 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1370  putative lipoprotein  29.01 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2874  type VI secretion lipoprotein  29.01 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1525  hypothetical protein  32.06 
 
 
164 aa  70.5  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2091  hypothetical protein  33.6 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0025  putative lipoprotein  29.91 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.567085  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2467  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  28 
 
 
164 aa  62.4  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1180  putative type VI secretion protein VasD-1  30.4 
 
 
154 aa  62  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0234801  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2450  hypothetical protein  34.58 
 
 
157 aa  60.8  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00189886  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3663  putative lipoprotein  28.88 
 
 
200 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353625  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3647  putative lipoprotein  28.88 
 
 
204 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0185188  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3638  putative lipoprotein  28.88 
 
 
204 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00119915  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3659  hypothetical protein  37.08 
 
 
172 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177991  normal  0.259907 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0166  hypothetical protein  30.53 
 
 
207 aa  57.4  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3249  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  27.78 
 
 
173 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2808  hypothetical protein  25 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000258047  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1076  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  28.06 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.556943  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4911  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  28.19 
 
 
210 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000403231  hitchhiker  0.009082 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2801  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  28.87 
 
 
178 aa  55.1  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5275  hypothetical protein  27.2 
 
 
212 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.174651  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2966  hypothetical protein  28.34 
 
 
292 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3094  hypothetical protein  28.57 
 
 
240 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518827  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2265  putative lipoprotein  30.69 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0637  hypothetical protein  29.2 
 
 
189 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2628  hypothetical protein  28.57 
 
 
240 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.189737  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2504  putative lipoprotein  28.57 
 
 
240 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02043  lipoprotein, putative  30.48 
 
 
202 aa  52.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4959  hypothetical protein  24.06 
 
 
251 aa  52  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.261667  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1202  hypothetical protein  26.89 
 
 
163 aa  52  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2523  hypothetical protein  28.16 
 
 
176 aa  51.6  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365008  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2770  hypothetical protein  27.91 
 
 
240 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124762  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0051  hypothetical protein  28.57 
 
 
190 aa  50.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01967  putative transmembrane protein  29.33 
 
 
193 aa  49.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77679  normal  0.402218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3243  hypothetical protein  29.29 
 
 
178 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.795372  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2641  hypothetical protein  29.31 
 
 
203 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0465  hypothetical protein  29.31 
 
 
203 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.144688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0443  hypothetical protein  29.31 
 
 
203 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  0.490833 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0400  hypothetical protein  27.85 
 
 
202 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000206514  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2932  hypothetical protein  28.45 
 
 
203 aa  44.7  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.147593  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2585  hypothetical protein  26.62 
 
 
193 aa  44.3  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.788173  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3557  hypothetical protein  28.45 
 
 
203 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0566246  normal  0.386059 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2487  hypothetical protein  25.9 
 
 
193 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2995  hypothetical protein  25.9 
 
 
193 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000478166 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4079  hypothetical protein  25.58 
 
 
265 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.185425  hitchhiker  0.000116946 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0379  hypothetical protein  27.59 
 
 
202 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0510591  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0319  putative lipoprotein  25.35 
 
 
181 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0392  putative lipoprotein  25.35 
 
 
181 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>