30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0234 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0234  type VI secretion lipoprotein  100 
 
 		 174 aa  358  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0232  type VI secretion lipoprotein  99.43 
 
 		 174 aa  356  9e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0240  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  98.28 
 
 		 174 aa  353  7.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1224  type VI secretion lipoprotein family protein  76.84 
 
 		 177 aa  287  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.804985 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1105  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  76.27 
 
 		 177 aa  284  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1076  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  47.7 
 
 		 174 aa  177  8e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.556943  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3249  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  46.78 
 
 		 173 aa  173  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0392  putative lipoprotein  46.37 
 
 		 181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2801  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  47.7 
 
 		 178 aa  171  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0319  putative lipoprotein  46.37 
 
 		 181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2523  hypothetical protein  38.73 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0051  hypothetical protein  36.63 
 
 		 190 aa  124  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3727  hypothetical protein  32.75 
 
 		 177 aa  120  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0025  putative lipoprotein  28.48 
 
 		 158 aa  87.8  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.567085  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1202  hypothetical protein  28.48 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4079  hypothetical protein  27.2 
 
 		 265 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.185425  hitchhiker  0.000116946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0151  putative lipoprotein  26.85 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2121  hypothetical protein  25.5 
 
 		 265 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2770  hypothetical protein  25.2 
 
 		 240 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124762  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000013  type VI secretion lipoprotein/VasD  24.84 
 
 		 151 aa  48.1  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00960  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 154 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0194597  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3094  hypothetical protein  25.2 
 
 		 240 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518827  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3230  hypothetical protein  27.2 
 
 		 265 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2628  hypothetical protein  25.2 
 
 		 240 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.189737  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2618  hypothetical protein  28.23 
 
 		 265 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890059  normal  0.147502 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2504  putative lipoprotein  25.2 
 
 		 240 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2265  putative lipoprotein  22.79 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5275  hypothetical protein  22.92 
 
 		 212 aa  42  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.174651  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000431  type VI secretion lipoprotein/VasD  21.33 
 
 		 166 aa  41.2  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0552  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  24.32 
 
 		 171 aa  40.8  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>