76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3128 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3128  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  286  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0000351189  normal  0.204022 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3484  hypothetical protein  98 
 
 
150 aa  283  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.764969  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2450  hypothetical protein  53.42 
 
 
157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00189886  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1595  hypothetical protein  32.26 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0306  type VI secretion lipoprotein  27.39 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.157499  normal  0.0453584 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0318  type VI secretion lipoprotein, family  27.39 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0341521  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0301  SciN protein  30.53 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.589759 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0312  type VI secretion lipoprotein, family  30.53 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.544183 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3025  putative lipoprotein  29.65 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1208  putative lipoprotein  30.32 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1775  putative lipoprotein  30.32 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0409935  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1590  putative lipoprotein  30.32 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0445  putative lipoprotein  30.32 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2843  putative lipoprotein  30.32 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2968  putative lipoprotein  30.32 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0396  putative lipoprotein  30.32 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5580  putative lipoprotein  24.24 
 
 
166 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6676  putative lipoprotein  29.81 
 
 
179 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.974139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42940  putative lipoprotein  28.18 
 
 
168 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.177757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0101  hypothetical protein  27.21 
 
 
160 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3910  hypothetical protein  28.3 
 
 
167 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374434  normal  0.782471 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0983  hypothetical protein  32.8 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5421  lipoprotein, putative  27.73 
 
 
166 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3606  putative lipoprotein  28.18 
 
 
168 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0251  putative lipoprotein  29.51 
 
 
172 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1116  putative type VI secretion protein VasD  28.46 
 
 
162 aa  58.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2376  hypothetical protein  29.84 
 
 
156 aa  58.2  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3477  hypothetical protein  27.78 
 
 
168 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0552  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  33.57 
 
 
171 aa  57  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1676  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  28.45 
 
 
172 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.973088  hitchhiker  0.0062275 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6111  hypothetical protein  34.31 
 
 
168 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.24398 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000013  type VI secretion lipoprotein/VasD  25.52 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05853  hypothetical protein  24 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2090  putative outer membrane lipoprotein  28.85 
 
 
166 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0124  putative lipoprotein  24 
 
 
180 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0137  SciN protein  24.67 
 
 
180 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000431  type VI secretion lipoprotein/VasD  24.8 
 
 
166 aa  53.5  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0160  SciN protein  25.19 
 
 
210 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3843  putative lipoprotein  31.54 
 
 
199 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00099713  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1912  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2187  SciN protein  33.33 
 
 
167 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1212  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.822471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00960  putative lipoprotein  28.78 
 
 
154 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0194597  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0925  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2770  hypothetical protein  33.02 
 
 
240 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124762  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26740  hypothetical protein  26.53 
 
 
192 aa  51.2  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251057  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2091  hypothetical protein  32.21 
 
 
156 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1180  putative type VI secretion protein VasD-1  27.42 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0234801  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2551  hypothetical protein  22.13 
 
 
163 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273704  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2319  hypothetical protein  26.06 
 
 
155 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00471412  hitchhiker  0.00131937 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0937  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  25.17 
 
 
170 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731961  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0151  putative lipoprotein  26.62 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1470  putative lipoprotein  31.82 
 
 
187 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.513143  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0210  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  32.22 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1482  hypothetical protein  28.71 
 
 
186 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1525  hypothetical protein  28.57 
 
 
164 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1370  putative lipoprotein  28.71 
 
 
179 aa  47.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2874  type VI secretion lipoprotein  28.71 
 
 
179 aa  47.8  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4959  hypothetical protein  27.84 
 
 
251 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.261667  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3094  hypothetical protein  30.19 
 
 
240 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518827  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0637  hypothetical protein  29.92 
 
 
189 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2504  putative lipoprotein  31.13 
 
 
240 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2628  hypothetical protein  30.19 
 
 
240 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.189737  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4911  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  27.35 
 
 
210 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000403231  hitchhiker  0.009082 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2265  putative lipoprotein  32.03 
 
 
181 aa  43.5  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2966  hypothetical protein  26.32 
 
 
292 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1692  putative lipoprotein  34.34 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.794584  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0025  putative lipoprotein  26.97 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.567085  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0239  SciN protein  34.34 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0330  SciN protein  34.34 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3647  putative lipoprotein  25.66 
 
 
204 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0185188  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3638  putative lipoprotein  25.66 
 
 
204 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00119915  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3663  putative lipoprotein  25.66 
 
 
200 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353625  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2523  hypothetical protein  26.53 
 
 
176 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365008  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01967  putative transmembrane protein  25.62 
 
 
193 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77679  normal  0.402218 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0379  hypothetical protein  25.71 
 
 
202 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0510591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>