108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2319 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2319  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  309  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00471412  hitchhiker  0.00131937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00960  putative lipoprotein  53.25 
 
 		 154 aa  167  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0194597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0151  putative lipoprotein  54.55 
 
 		 154 aa  167  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3910  hypothetical protein  39.33 
 
 		 167 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374434  normal  0.782471 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0552  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  41.48 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0983  hypothetical protein  41.32 
 
 		 167 aa  104  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4054  hypothetical protein  41.67 
 
 		 197 aa  101  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000378046 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5580  putative lipoprotein  36.88 
 
 		 166 aa  100  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1676  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  35.92 
 
 		 172 aa  100  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.973088  hitchhiker  0.0062275 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5421  lipoprotein, putative  42.74 
 
 		 166 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6111  hypothetical protein  41.94 
 
 		 168 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24398 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0937  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  40.8 
 
 		 170 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2376  hypothetical protein  37.4 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3025  putative lipoprotein  34.59 
 
 		 180 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6676  putative lipoprotein  36.72 
 
 		 179 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.974139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42940  putative lipoprotein  37.12 
 
 		 168 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.177757 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0124  putative lipoprotein  35.88 
 
 		 180 aa  93.2  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0306  type VI secretion lipoprotein  39.34 
 
 		 163 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.157499  normal  0.0453584 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0318  type VI secretion lipoprotein, family  39.34 
 
 		 163 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0341521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0312  type VI secretion lipoprotein, family  39.34 
 
 		 163 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.544183 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0301  SciN protein  39.34 
 
 		 163 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.589759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3606  putative lipoprotein  36.36 
 
 		 168 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3477  hypothetical protein  38.94 
 
 		 168 aa  91.7  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0160  SciN protein  34.35 
 
 		 210 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3843  putative lipoprotein  40.38 
 
 		 199 aa  90.1  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00099713  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0137  SciN protein  34.35 
 
 		 180 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0101  hypothetical protein  36.36 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2551  hypothetical protein  35.54 
 
 		 163 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273704  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1116  putative type VI secretion protein VasD  30.08 
 
 		 162 aa  88.2  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26740  hypothetical protein  35.25 
 
 		 192 aa  88.2  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251057  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0210  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  35.16 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2090  putative outer membrane lipoprotein  37.9 
 
 		 166 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2091  hypothetical protein  32.88 
 
 		 156 aa  87.4  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000013  type VI secretion lipoprotein/VasD  31.06 
 
 		 151 aa  86.3  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1470  putative lipoprotein  37.5 
 
 		 187 aa  84.3  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.513143  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1912  hypothetical protein  37.38 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0925  hypothetical protein  37.38 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1212  hypothetical protein  37.38 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.822471  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2187  SciN protein  37.38 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000431  type VI secretion lipoprotein/VasD  33.09 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05853  hypothetical protein  33.88 
 
 		 149 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1595  hypothetical protein  30.71 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2997  putative lipoprotein  32.59 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0396  putative lipoprotein  32.79 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1208  putative lipoprotein  32.79 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1692  putative lipoprotein  37.38 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.794584  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1525  hypothetical protein  31.54 
 
 		 164 aa  72  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1590  putative lipoprotein  32.79 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1775  putative lipoprotein  32.79 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0409935  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0330  SciN protein  37.38 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2968  putative lipoprotein  32.79 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0239  SciN protein  37.38 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2843  putative lipoprotein  32.79 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0445  putative lipoprotein  32.79 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0251  putative lipoprotein  30.69 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0025  putative lipoprotein  26.12 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.567085  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1370  putative lipoprotein  27.43 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2874  type VI secretion lipoprotein  27.43 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1482  hypothetical protein  27.43 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01967  putative transmembrane protein  30.77 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77679  normal  0.402218 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2808  hypothetical protein  27.59 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000258047  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1202  hypothetical protein  26.83 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2450  hypothetical protein  28.97 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00189886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2523  hypothetical protein  27.27 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0051  hypothetical protein  25.45 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2467  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  32.56 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02043  lipoprotein, putative  24.1 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1180  putative type VI secretion protein VasD-1  28.57 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0234801  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2265  putative lipoprotein  27.54 
 
 		 181 aa  54.3  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0319  putative lipoprotein  31.68 
 
 		 181 aa  50.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0392  putative lipoprotein  31.68 
 
 		 181 aa  50.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3249  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  26.42 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2801  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  26.71 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3094  hypothetical protein  33.33 
 
 		 240 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518827  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2628  hypothetical protein  33.33 
 
 		 240 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.189737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1076  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  27.36 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.556943  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3659  hypothetical protein  30 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177991  normal  0.259907 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0166  hypothetical protein  32.04 
 
 		 207 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4911  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  25.38 
 
 		 210 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000403231  hitchhiker  0.009082 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2487  hypothetical protein  25.38 
 
 		 193 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2585  hypothetical protein  25.38 
 
 		 193 aa  47.4  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.788173  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2966  hypothetical protein  25.38 
 
 		 292 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3647  putative lipoprotein  25.38 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0185188  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0637  hypothetical protein  26.92 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3638  putative lipoprotein  25.38 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00119915  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3663  putative lipoprotein  25.38 
 
 		 200 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2995  hypothetical protein  24.81 
 
 		 193 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000478166 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3727  hypothetical protein  22.32 
 
 		 177 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2504  putative lipoprotein  31.03 
 
 		 240 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0802  hypothetical protein  25.38 
 
 		 193 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3243  hypothetical protein  32.14 
 
 		 178 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.795372  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4079  hypothetical protein  21.98 
 
 		 265 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.185425  hitchhiker  0.000116946 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2770  hypothetical protein  31.03 
 
 		 240 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124762  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4959  hypothetical protein  34.04 
 
 		 251 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.261667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3484  hypothetical protein  25.53 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.764969  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0379  hypothetical protein  30.49 
 
 		 202 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0510591  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2121  hypothetical protein  23.08 
 
 		 265 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3230  hypothetical protein  24.18 
 
 		 265 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2618  hypothetical protein  23.08 
 
 		 265 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890059  normal  0.147502 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1802  hypothetical protein  25.61 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.56234  normal  0.0484163 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>