67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05853 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05853  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  302  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000431  type VI secretion lipoprotein/VasD  92.62 
 
 		 166 aa  282  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0552  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  29.58 
 
 		 171 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0983  hypothetical protein  34.15 
 
 		 167 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000013  type VI secretion lipoprotein/VasD  35.29 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00960  putative lipoprotein  33.86 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0194597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0151  putative lipoprotein  34.65 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2090  putative outer membrane lipoprotein  36.89 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3606  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6111  hypothetical protein  31.88 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24398 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42940  putative lipoprotein  33.62 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.177757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2319  hypothetical protein  35.09 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00471412  hitchhiker  0.00131937 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0101  hypothetical protein  31.5 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3477  hypothetical protein  32.26 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0937  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  35.64 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731961  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5421  lipoprotein, putative  37.37 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2551  hypothetical protein  31.53 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273704  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3910  hypothetical protein  34.17 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374434  normal  0.782471 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2376  hypothetical protein  36.54 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1676  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  33.65 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.973088  hitchhiker  0.0062275 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5580  putative lipoprotein  33.66 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2187  SciN protein  32.67 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1912  hypothetical protein  32.67 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0925  hypothetical protein  32.67 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1212  hypothetical protein  32.67 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.822471  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0301  SciN protein  29.73 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.589759 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0312  type VI secretion lipoprotein, family  29.73 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.544183 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0306  type VI secretion lipoprotein  29.73 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.157499  normal  0.0453584 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0318  type VI secretion lipoprotein, family  29.73 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0341521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1116  putative type VI secretion protein VasD  30.51 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6676  putative lipoprotein  33.98 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.974139 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4054  hypothetical protein  30.09 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000378046 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1692  putative lipoprotein  33.66 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.794584  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0137  SciN protein  32.43 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0239  SciN protein  33.66 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0330  SciN protein  33.66 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0160  SciN protein  31.53 
 
 		 210 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3025  putative lipoprotein  32.32 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3843  putative lipoprotein  31.96 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00099713  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0124  putative lipoprotein  32.69 
 
 		 180 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1525  hypothetical protein  27.73 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1202  hypothetical protein  26.32 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2808  hypothetical protein  25.47 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000258047  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0166  hypothetical protein  33.08 
 
 		 207 aa  53.9  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26740  hypothetical protein  31.63 
 
 		 192 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251057  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2450  hypothetical protein  27.62 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00189886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1370  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 179 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2523  hypothetical protein  30.33 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1482  hypothetical protein  27.27 
 
 		 186 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2874  type VI secretion lipoprotein  27.27 
 
 		 179 aa  52  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2997  putative lipoprotein  27.14 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0025  putative lipoprotein  27.59 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.567085  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1470  putative lipoprotein  29.63 
 
 		 187 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.513143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0210  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  29.67 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2091  hypothetical protein  24.03 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0051  hypothetical protein  23.48 
 
 		 190 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4959  hypothetical protein  30.21 
 
 		 251 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.261667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3484  hypothetical protein  24 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.764969  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3727  hypothetical protein  28.43 
 
 		 177 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3128  hypothetical protein  24 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0000351189  normal  0.204022 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1180  putative type VI secretion protein VasD-1  30.43 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0234801  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2770  hypothetical protein  25.74 
 
 		 240 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124762  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0637  hypothetical protein  23.58 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2265  putative lipoprotein  22.92 
 
 		 181 aa  41.6  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2504  putative lipoprotein  23.36 
 
 		 240 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4079  hypothetical protein  25.77 
 
 		 265 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.185425  hitchhiker  0.000116946 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5275  hypothetical protein  28.43 
 
 		 212 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.174651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>