47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2179 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2179  putative lipoprotein  100 
 
 		 189 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000218689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3638  putative lipoprotein  38.6 
 
 		 204 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00119915  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3647  putative lipoprotein  38.6 
 
 		 204 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0185188  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3663  putative lipoprotein  38.6 
 
 		 200 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353625  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2966  hypothetical protein  38.01 
 
 		 292 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01967  putative transmembrane protein  35.29 
 
 		 193 aa  125  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77679  normal  0.402218 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02043  lipoprotein, putative  37.04 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4911  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  35.09 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000403231  hitchhiker  0.009082 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0379  hypothetical protein  38.46 
 
 		 202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0510591  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2932  hypothetical protein  37.18 
 
 		 203 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.147593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0400  hypothetical protein  37.82 
 
 		 202 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000206514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3557  hypothetical protein  37.93 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0566246  normal  0.386059 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0443  hypothetical protein  36.55 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  0.490833 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2641  hypothetical protein  36.55 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0465  hypothetical protein  36.55 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.144688  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4959  hypothetical protein  32.91 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.261667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2770  hypothetical protein  34.13 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124762  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2628  hypothetical protein  36.19 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.189737  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3094  hypothetical protein  36.19 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518827  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2504  putative lipoprotein  35.24 
 
 		 240 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0637  hypothetical protein  26.21 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0552  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  28.8 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2265  putative lipoprotein  31.62 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0124  putative lipoprotein  26.92 
 
 		 180 aa  49.3  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5580  putative lipoprotein  25 
 
 		 166 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5421  lipoprotein, putative  25.71 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3243  hypothetical protein  26.53 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.795372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0160  SciN protein  25 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1595  hypothetical protein  26.23 
 
 		 171 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1775  putative lipoprotein  24.59 
 
 		 172 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0409935  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1208  putative lipoprotein  24.59 
 
 		 191 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0445  putative lipoprotein  24.59 
 
 		 172 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2843  putative lipoprotein  24.59 
 
 		 172 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2968  putative lipoprotein  24.59 
 
 		 172 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1590  putative lipoprotein  24.59 
 
 		 172 aa  45.4  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0137  SciN protein  24.04 
 
 		 180 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0396  putative lipoprotein  24.59 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1202  hypothetical protein  27.52 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0251  putative lipoprotein  26.67 
 
 		 172 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5275  hypothetical protein  27.03 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.174651  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2376  hypothetical protein  29.03 
 
 		 156 aa  42.4  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0101  hypothetical protein  24.56 
 
 		 160 aa  42  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2585  hypothetical protein  25.53 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.788173  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0166  hypothetical protein  27.45 
 
 		 207 aa  41.2  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3025  putative lipoprotein  23.58 
 
 		 180 aa  41.2  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0312  type VI secretion lipoprotein, family  24.51 
 
 		 163 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.544183 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0301  SciN protein  24.51 
 
 		 163 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.589759 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>