65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1802 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1802  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.56234  normal  0.0484163 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2487  hypothetical protein  65.41 
 
 
193 aa  220  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2995  hypothetical protein  65.41 
 
 
193 aa  220  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000478166 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0802  hypothetical protein  64.78 
 
 
193 aa  218  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2585  hypothetical protein  64.78 
 
 
193 aa  218  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.788173  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3243  hypothetical protein  50.31 
 
 
178 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.795372  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3659  hypothetical protein  45.45 
 
 
172 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177991  normal  0.259907 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5275  hypothetical protein  38.92 
 
 
212 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.174651  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0637  hypothetical protein  40.12 
 
 
189 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3133  type VI secretion lipoprotein  47.97 
 
 
127 aa  105  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2265  putative lipoprotein  27.33 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5580  putative lipoprotein  27.93 
 
 
166 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000013  type VI secretion lipoprotein/VasD  23.6 
 
 
151 aa  57.8  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3606  putative lipoprotein  29.63 
 
 
168 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5421  lipoprotein, putative  26.79 
 
 
166 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42940  putative lipoprotein  28.89 
 
 
168 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.177757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0552  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  31.78 
 
 
171 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2504  putative lipoprotein  29.5 
 
 
240 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3007  hypothetical protein  50 
 
 
50 aa  51.2  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.118842  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3094  hypothetical protein  30.22 
 
 
240 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0518827  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2628  hypothetical protein  30.22 
 
 
240 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.189737  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2551  hypothetical protein  29.25 
 
 
163 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273704  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02043  lipoprotein, putative  25.97 
 
 
202 aa  49.3  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4959  hypothetical protein  28.65 
 
 
251 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.261667  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1676  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  27.34 
 
 
172 aa  48.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.973088  hitchhiker  0.0062275 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4079  hypothetical protein  28.42 
 
 
265 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.185425  hitchhiker  0.000116946 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0301  SciN protein  24.62 
 
 
163 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.589759 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0312  type VI secretion lipoprotein, family  24.62 
 
 
163 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.544183 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0318  type VI secretion lipoprotein, family  24.62 
 
 
163 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0341521  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0306  type VI secretion lipoprotein  24.62 
 
 
163 aa  48.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.157499  normal  0.0453584 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2770  hypothetical protein  30.51 
 
 
240 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124762  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2808  hypothetical protein  31.82 
 
 
154 aa  47.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000258047  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2091  hypothetical protein  29.32 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2618  hypothetical protein  28.42 
 
 
265 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890059  normal  0.147502 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3230  hypothetical protein  29.35 
 
 
265 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0101  hypothetical protein  25.32 
 
 
160 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1595  hypothetical protein  29.76 
 
 
171 aa  45.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2376  hypothetical protein  23.61 
 
 
156 aa  45.1  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2121  hypothetical protein  29.07 
 
 
265 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492075  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1470  putative lipoprotein  26.19 
 
 
187 aa  44.3  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.513143  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2090  putative outer membrane lipoprotein  29.81 
 
 
166 aa  44.3  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3727  hypothetical protein  23.53 
 
 
177 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0025  putative lipoprotein  22.32 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.567085  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3843  putative lipoprotein  24.43 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00099713  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2319  hypothetical protein  25.61 
 
 
155 aa  43.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00471412  hitchhiker  0.00131937 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0124  putative lipoprotein  26.71 
 
 
180 aa  42.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0137  SciN protein  26.81 
 
 
180 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3025  putative lipoprotein  25.71 
 
 
180 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0937  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  27.45 
 
 
170 aa  42.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731961  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0160  SciN protein  26.09 
 
 
210 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6676  putative lipoprotein  25.96 
 
 
179 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.974139 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0925  hypothetical protein  31.19 
 
 
167 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1590  putative lipoprotein  26.47 
 
 
172 aa  42  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1212  hypothetical protein  31.19 
 
 
167 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.822471  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1775  putative lipoprotein  26.47 
 
 
172 aa  42  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0409935  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2968  putative lipoprotein  26.47 
 
 
172 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2843  putative lipoprotein  26.47 
 
 
172 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0396  putative lipoprotein  26.47 
 
 
179 aa  42  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1912  hypothetical protein  31.19 
 
 
167 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0445  putative lipoprotein  26.47 
 
 
172 aa  42  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2187  SciN protein  31.19 
 
 
167 aa  41.6  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1208  putative lipoprotein  26.44 
 
 
191 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1525  hypothetical protein  21.64 
 
 
164 aa  42  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0251  putative lipoprotein  26.44 
 
 
172 aa  41.6  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4054  hypothetical protein  28.26 
 
 
197 aa  41.2  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000378046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>