106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6676 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6676  putative lipoprotein  100 
 
 		 179 aa  362  2e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.974139 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3025  putative lipoprotein  79.44 
 
 		 180 aa  285  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0124  putative lipoprotein  61.11 
 
 		 180 aa  223  8e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0137  SciN protein  59.44 
 
 		 180 aa  218  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0160  SciN protein  59.44 
 
 		 210 aa  216  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1676  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  44.74 
 
 		 172 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.973088  hitchhiker  0.0062275 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0983  hypothetical protein  50.96 
 
 		 167 aa  155  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2090  putative outer membrane lipoprotein  49.67 
 
 		 166 aa  148  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3910  hypothetical protein  47.68 
 
 		 167 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374434  normal  0.782471 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3477  hypothetical protein  48.25 
 
 		 168 aa  141  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0312  type VI secretion lipoprotein, family  43.12 
 
 		 163 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.544183 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0301  SciN protein  43.12 
 
 		 163 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.589759 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0306  type VI secretion lipoprotein  43.12 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.157499  normal  0.0453584 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0318  type VI secretion lipoprotein, family  43.12 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0341521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0937  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  44.44 
 
 		 170 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.731961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6111  hypothetical protein  45.45 
 
 		 168 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24398 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1912  hypothetical protein  43.57 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0925  hypothetical protein  43.57 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1212  hypothetical protein  43.57 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.822471  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2187  SciN protein  43.57 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1692  putative lipoprotein  43.57 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.794584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0330  SciN protein  43.57 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0239  SciN protein  43.57 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26740  hypothetical protein  36.55 
 
 		 192 aa  98.2  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.251057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00960  putative lipoprotein  35.38 
 
 		 154 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0194597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0151  putative lipoprotein  35.38 
 
 		 154 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5580  putative lipoprotein  39.29 
 
 		 166 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5421  lipoprotein, putative  41.28 
 
 		 166 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0101  hypothetical protein  36.44 
 
 		 160 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2319  hypothetical protein  35.21 
 
 		 155 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00471412  hitchhiker  0.00131937 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0210  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  38.58 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154927  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42940  putative lipoprotein  31.72 
 
 		 168 aa  87  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.177757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3606  putative lipoprotein  36.61 
 
 		 168 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1116  putative type VI secretion protein VasD  32.28 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0396  putative lipoprotein  39.22 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1208  putative lipoprotein  39.22 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1590  putative lipoprotein  39.22 
 
 		 172 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1775  putative lipoprotein  39.22 
 
 		 172 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0409935  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2968  putative lipoprotein  39.22 
 
 		 172 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2843  putative lipoprotein  39.22 
 
 		 172 aa  85.5  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0445  putative lipoprotein  39.22 
 
 		 172 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0251  putative lipoprotein  39.22 
 
 		 172 aa  85.5  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1595  hypothetical protein  40.59 
 
 		 171 aa  85.1  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1470  putative lipoprotein  36.3 
 
 		 187 aa  84.7  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.513143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3843  putative lipoprotein  33.77 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00099713  normal  0.38953 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0552  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  35.04 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000013  type VI secretion lipoprotein/VasD  35.71 
 
 		 151 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2376  hypothetical protein  37.39 
 
 		 156 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2551  hypothetical protein  30.43 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273704  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4054  hypothetical protein  39.13 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000378046 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1370  putative lipoprotein  29.69 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2874  type VI secretion lipoprotein  29.69 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1482  hypothetical protein  29.69 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2450  hypothetical protein  36.75 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00189886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000431  type VI secretion lipoprotein/VasD  30.83 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2997  putative lipoprotein  37.5 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05853  hypothetical protein  33.98 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2091  hypothetical protein  32.26 
 
 		 156 aa  65.5  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0025  putative lipoprotein  26.76 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.567085  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1525  hypothetical protein  29.37 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5275  hypothetical protein  27.59 
 
 		 212 aa  62  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.174651  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4959  hypothetical protein  28.57 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.261667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2467  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  30.77 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1180  putative type VI secretion protein VasD-1  25.4 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0234801  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3659  hypothetical protein  27.05 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177991  normal  0.259907 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3647  putative lipoprotein  28.8 
 
 		 204 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0185188  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0051  hypothetical protein  27.68 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3638  putative lipoprotein  28.8 
 
 		 204 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00119915  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3663  putative lipoprotein  28.8 
 
 		 200 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.353625  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2585  hypothetical protein  28.57 
 
 		 193 aa  52.4  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.788173  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2966  hypothetical protein  28.12 
 
 		 292 aa  52.4  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02043  lipoprotein, putative  25.93 
 
 		 202 aa  52  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0637  hypothetical protein  24.6 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2487  hypothetical protein  27.68 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2995  hypothetical protein  27.68 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000478166 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0802  hypothetical protein  28.57 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3484  hypothetical protein  31.06 
 
 		 150 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.764969  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2618  hypothetical protein  30.48 
 
 		 265 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890059  normal  0.147502 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4079  hypothetical protein  28.57 
 
 		 265 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.185425  hitchhiker  0.000116946 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1202  hypothetical protein  28.42 
 
 		 163 aa  48.5  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2121  hypothetical protein  30.48 
 
 		 265 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3243  hypothetical protein  27.03 
 
 		 178 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.795372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2523  hypothetical protein  28.04 
 
 		 176 aa  47.8  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3128  hypothetical protein  29.81 
 
 		 150 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0000351189  normal  0.204022 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3249  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  23.17 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2265  putative lipoprotein  24.86 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2801  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  23.78 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0319  putative lipoprotein  30.68 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0392  putative lipoprotein  30.68 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2808  hypothetical protein  23.93 
 
 		 154 aa  44.3  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000258047  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1076  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  27.96 
 
 		 174 aa  44.7  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.556943  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4911  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  26.42 
 
 		 210 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000403231  hitchhiker  0.009082 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3557  hypothetical protein  29.49 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0566246  normal  0.386059 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2641  hypothetical protein  29.49 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.212724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0465  hypothetical protein  29.49 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.144688  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2932  hypothetical protein  29.49 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.147593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3230  hypothetical protein  26.67 
 
 		 265 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0443  hypothetical protein  29.49 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal  0.490833 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0400  hypothetical protein  29.49 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000206514  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01967  putative transmembrane protein  26.8 
 
 		 193 aa  42  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77679  normal  0.402218 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>